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牦牛肌钙蛋白Ⅰ基因家族的克隆及组织表达分析
引用本文:向娅,柴志欣,王吉坤,信金伟,王会,王嘉博,武志娟,钟金城,姬秋梅.牦牛肌钙蛋白Ⅰ基因家族的克隆及组织表达分析[J].华北农学报,2020,35(2):228-238.
作者姓名:向娅  柴志欣  王吉坤  信金伟  王会  王嘉博  武志娟  钟金城  姬秋梅
作者单位:西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室,四川 成都 610041,省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室,西藏 拉萨 850000,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室,四川 成都 610041,省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室,西藏 拉萨 850000
基金项目:国家肉牛牦牛产业技术体系项目;西南民族大学研究生创新型科研项目;青藏高原生态畜牧业协同创新中心开放基金;西藏自治区财政专项
摘    要:为了克隆TNNI基因家族,预测其蛋白结构和功能,并分析其在牦牛不同组织中的表达差异,以0.5岁健康的类乌齐牦牛为试验材料,采用RT-PCR技术克隆牦牛肌钙蛋白Ⅰ基因家族的CDS区序列并进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR技术检测TNNI基因家族各成员的mRNA表达水平。结果表明,TNNI1、TNNI2和TNNI3基因CDS区大小分别为564,549,639 bp,分别编码187,182,212个氨基酸残基。预测分析结果显示:TNNI基因家族编码的蛋白质均为偏碱性蛋白,蛋白结构不稳定,均无跨膜结构域,无信号肽,属非分泌型蛋白;二、三级结构均以α-螺旋为主,均含有肌蛋白超家族保守结构域。系统进化树分析表明:类乌齐牦牛TNNI1基因与水牛的亲缘关系最近,其次是绵羊、黄牛,与小鼠亲缘关系最远;TNNI2和TNNI3均与黄牛、水牛的亲缘关系较近,与其他亲缘关系较远。实时荧光定量PCR结果显示,TNNI1和TNNI2基因在臀肌中的相对表达量最高,且TNNI1基因在心脏、肝脏和肺脏中的表达量显著高于TNNI2基因(P0.05),TNNI3基因在心脏中表达量较高,而在肺脏、臀肌和肝脏中表达量低。

关 键 词:牦牛  肌钙蛋白Ⅰ基因家族  克隆  组织表达

Cloning and Tissue Expression of Troponin Ⅰ Gene Family in Yak
XIANG Ya,CHAI Zhixin,WANG Jikun,XIN Jinwei,WANG Hui,WANG Jiabo,WU Zhijuan,ZHONG Jincheng,JI Qiumei.Cloning and Tissue Expression of Troponin Ⅰ Gene Family in Yak[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2020,35(2):228-238.
Authors:XIANG Ya  CHAI Zhixin  WANG Jikun  XIN Jinwei  WANG Hui  WANG Jiabo  WU Zhijuan  ZHONG Jincheng  JI Qiumei
Abstract:
Keywords:
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