| 野桑蚕Hippo通路核心基因的鉴定与序列比较分析 |
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| 引用本文： | 孟刚,彭云武,王瑞娴,楚渠,梁嘉俊,凌君. 野桑蚕Hippo通路核心基因的鉴定与序列比较分析[J]. 湖北农业科学, 2020, 59(13): 149-153. DOI: 10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2020.13.034 |
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| 作者姓名： | 孟刚 彭云武 王瑞娴 楚渠 梁嘉俊 凌君 |
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| 作者单位： | 安康学院陕西省蚕桑重点实验室,陕西 安康 725000,安康学院陕西省蚕桑重点实验室,陕西 安康 725000,安康学院陕西省蚕桑重点实验室,陕西 安康 725000,安康学院陕西省蚕桑重点实验室,陕西 安康 725000,安康学院陕西省蚕桑重点实验室,陕西 安康 725000,安康学院陕西省蚕桑重点实验室,陕西 安康 725000 |
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| 基金项目： | 安康学院硕士点培育学科建设专项;安康学院高层次人才科研专项;陕西省教育厅重点实验室科研计划项目 |
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| 摘 要： | Hippo信号通路在动物生长发育过程中起到关键作用。根据已知的Hippo通路组成基因序列,利用BLAST软件同源鉴定野桑蚕(Bombyx mandarina)转录组中的Hippo通路组成基因序列,利用生物信息学工具(ORFinder、web CD-search tool、Expasy-protparam、EMBL-EBI、MEME)分析蛋白质相对分子质量、等电点、二级结构、保守结构域和保守基序等。利用Clustalx和MEGA 6.0进行同源序列比对并构建系统进化树。在野桑蚕中鉴定了salvador、warts、mats、yorkie和scalloped同源基因,并预测了ORF框和编码蛋白。结果表明,野桑蚕Warts、Sav和Mats与家蚕同源蛋白的一致性均在98%以上,Yki和Scalloped与家蚕一致性分别为89.02%和79.13%。比较两者差异,家蚕Yki、Sd蛋白分别缺失了近WW2结构域和在YAP结合结构域中存在蛋白片段插入,野桑蚕Sd蛋白缺失了核定位信号基序和脯氨酸富集基序之间的铰链区。Yki和Sd可按照物种科属分别聚类,野桑蚕与家蚕聚为一支,表明这些同源蛋白在功能相似的...
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| 关 键 词： | 野桑蚕(Bombyx mandarina) Hippo通路 聚类分析 |
The identification and sequence analysis of the core gene of Hippo pathway in wild silkworm |
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| MENG Gang,PENG Yun-wu,WANG Rui-xian,CHU Qu,LIANG Jia-jun,LING Jun. The identification and sequence analysis of the core gene of Hippo pathway in wild silkworm[J]. Hubei Agricultural Sciences, 2020, 59(13): 149-153. DOI: 10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2020.13.034 |
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| Authors: | MENG Gang PENG Yun-wu WANG Rui-xian CHU Qu LIANG Jia-jun LING Jun |
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