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转录组及代谢组联合解析玉米响应花粒期高温胁迫机制
引用本文:李川,乔江方,黄璐,张美微,张盼盼,牛军,刘京宝.转录组及代谢组联合解析玉米响应花粒期高温胁迫机制[J].华北农学报,2020,35(1):8-21.
作者姓名:李川  乔江方  黄璐  张美微  张盼盼  牛军  刘京宝
作者单位:河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002,河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002,河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002,河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002,河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002,河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002,河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002
基金项目:国家自然科学基金项目;"十三五"重点研究计划课题
摘    要:为了探明我国玉米主要推广品种郑单958、先玉335花粒期高温胁迫下基因表达及代谢物差异,挖掘玉米响应高温胁迫的关键基因及代谢物,利用Illumina HiSeq~(TM) 2500高通量测序技术分别对郑单958、先玉335高温胁迫7,14 d的穗位叶及对照叶进行高通量转录组测序,利用广泛靶向代谢组测序技术对样品进行高通量代谢物测序。转录组测序共获得214.81 Gb干净序列。郑单958高温胁迫7 d后检测到49个差异表达基因,其中24个为上调基因。继续高温胁迫14 d共检测到306个差异表达基因,其中130个为上调基因。高温胁迫7 d与高温胁迫14 d对比组中检测到1 462个差异表达基因,其中647个为上调基因。先玉335高温胁迫7 d后共检测到381个差异表达基因,164个上调基因。继续高温胁迫14 d后共检测到299个差异表达基因,226个为上调基因。高温胁迫7 d与高温胁迫14 d对比组中共检测到2 481个差异表达基因,其中1 275个上调基因。在郑单958、先玉335高温胁迫7 d后对比组中检测到6 646个差异表达基因,其中3 253个上调基因。在郑单958、先玉335高温胁迫14 d对比组中检测到5 958个差异表达基因,其中3 110个上调基因。代谢物测序共检测到654个代谢物,郑单958高温胁迫7 d后共检测出28个差异代谢物,共注释到5个代谢通路中。高温胁迫14 d后共检测出54个差异代谢物,共注释到13个代谢通路中,其中9个差异代谢物呈上调表达。先玉335高温胁迫7 d后检测出98个差异代谢物,共注释到24个代谢通路中,其中43个差异代谢物呈上调表达。先玉335高温胁迫14 d后共检测出38个差异代谢物,共注释到13个代谢通路中,其中14个上调表达。郑单958高温胁迫7 d与先玉335高温胁迫7 d对比组共检测出144个差异代谢物,共注释到36个代谢通路中,其中81个差异代谢物呈上调表达。郑单958高温胁迫14 d与先玉335高温胁迫14 d对比组共检测出158个差异代谢物,共注释到40个代谢通路中,其中81个差异代谢物呈上调表达。

关 键 词:玉米  高温胁迫  花粒期  高通量转录组测序  代谢组学分析  差异表达基因
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