| 山羊APOE基因克隆及组织细胞表达模式分析 |
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| 引用本文： | 杜宇,王永,张亚楠,许晴,朱江江,林亚秋.山羊APOE基因克隆及组织细胞表达模式分析[J].华北农学报,2020,35(3):217-224. |
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| 作者姓名： | 杜宇 王永 张亚楠 许晴 朱江江 林亚秋 |
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| 作者单位： | 西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部,四川省重点实验室,四川 成都 610041;西南民族大学 生命科学与技术学院,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部,四川省重点实验室,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部,四川省重点实验室,四川 成都 610041;西南民族大学 生命科学与技术学院,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部,四川省重点实验室,四川 成都 610041;西南民族大学 生命科学与技术学院,四川 成都 610041,西南民族大学 生命科学与技术学院,四川 成都 610041,西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部,四川省重点实验室,四川 成都 610041;西南民族大学 生命科学与技术学院,四川 成都 610041 |
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| 基金项目： | 四川省应用基础研究计划;国家自然科学基金;国家重点研究计划;西南民族大学研究生创新型科研项目 |
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| 摘 要： | 旨在克隆山羊载脂蛋白E(Apolipoprotein E,APOE)基因序列并进行生物信息学分析,明确APOE基因在山羊各组织及分化前后脂肪细胞中的表达模式,利用RT-PCR及3′RACE方法克隆山羊APOE基因序列,利用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,qPCR)方法检测该基因在山羊心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪等13个组织中的表达水平以及在皮下前体脂肪细胞成脂分化过程中的表达变化情况。结果表明,RT-PCR方法获得山羊APOE基因序列970 bp,其中ORF 951 bp,5′UTR 7 bp,3′UTR 12 bp(GenBank登录号:MN049956);3′RACE法获得3′UTR 152 bp(登录号:MN049957);Targetscan和Mirbase预测得知miR-22-3p可能靶标山羊APOE基因;蛋白预测显示山羊APOE编码316个氨基酸,是一个具有信号肽、无跨膜结构域的不稳定酸性蛋白;亚细胞定位结果发现APOE在细胞外、细胞质、液泡、细胞核以及内质网中均发挥生物学作用;进化树显示该基因在各物种的同源性较高,与绵羊、藏羚羊和牛的亲缘关系最近;基因组织表达谱显示山羊APOE在皮下脂肪中的表达量最高,极显著高于其他组织(P0.01);时序表达结果显示随着皮下前体脂肪细胞分化的进行,APOE基因表达呈上升趋势且在诱导分化60 h时表达量最高。结果为最终进一步揭示APOE基因在脂肪细胞分化、脂肪沉积及脂质代谢中的作用提供了基础理论数据。
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| 关 键 词： | 山羊 APOE 克隆 组织表达 时序表达 |
Cloning and Tissue Cell Expression Pattern Analysis of Apolipoprotein E (APOE) Gene in Goat |
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| DU Yu,WANG Yong,ZHANG Yanan,XU Qing,ZHU Jiangjiang,LIN Yaqiu.Cloning and Tissue Cell Expression Pattern Analysis of Apolipoprotein E (APOE) Gene in Goat[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2020,35(3):217-224. |
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| Authors: | DU Yu WANG Yong ZHANG Yanan XU Qing ZHU Jiangjiang LIN Yaqiu |
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