| 葡萄HXK基因家族的鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 王萍萍,霍建强,刘涛,梁国平,毛娟.葡萄HXK基因家族的鉴定与表达分析[J].华北农学报,2020,35(1):57-64. |
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| 作者姓名： | 王萍萍 霍建强 刘涛 梁国平 毛娟 |
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| 作者单位： | 甘肃农业大学 园艺学院,甘肃 兰州 730070,甘肃农业大学 园艺学院,甘肃 兰州 730070,甘肃农业大学 园艺学院,甘肃 兰州 730070,甘肃农业大学 园艺学院,甘肃 兰州 730070,甘肃农业大学 园艺学院,甘肃 兰州 730070 |
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| 基金项目： | 甘肃省科技重大专项;甘肃农业大学青年导师基金;省委组织部陇原青年创新团队项目 |
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| 摘 要： | 为了对葡萄HXK基因家族进行鉴定和表达分析,利用拟南芥和玉米的HXK(Hexokinase)基因注册序列,从葡萄全基因组中鉴定得到HXK基因4个,并命名为VvHXK1、VvHXK2、VvHXK3和VvHXK4,对其进行生物信息学分析。蛋白质理化性质分析结果表明,每个基因编码的氨基酸个数分布在412-524 aa,VvHXK4是碱性蛋白,其余3个均为酸性蛋白;亚细胞定位分析表明,4个VvHXK基因都在细胞质中表达,且VvHXK4主要定位于叶绿体,而VvHXK2也存在于线粒体和细胞核中;蛋白质的二级结构预测表明,4个VvHXK基因编码的蛋白主要以α-螺旋为主;外显子结构分析表明,除VvHXK1含10个外显子外,其余3个都有9个外显子,说明VvHXK基因比较保守;启动子顺式作用元件分析表明,4个VvHXK基因均含有ABA响应元件和MYB及WRKY转录因子的结合区域,而VvHXK4中没有发现低温响应元件;系统进化树分析表明,VvHXK1与拟南芥AtHXK1的同源关系最近,推测其不仅具有调节生长发育,影响根系的生长等功能,而且具有加速衰老的作用。VvHXK2与马铃薯StHXK1的同源关系最近,推测其具有使叶绿体中的葡萄糖磷酸化活性升高的功能。VvHXK3与马铃薯StHXKRP1的同源关系最近,可能具有诱导离体叶片中糖表达的作用。VvHXK4与菠菜SoHXK1的同源关系最近。荧光定量分析表明,VvHXK2、VvHXK3和VvHXK4均在20 g/L的葡萄糖处理下相对表达量最高,即其对葡萄糖磷酸化最显著,在果糖和蔗糖的处理下表达量较低。
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| 关 键 词： | 葡萄 HXK基因家族 生物信息学分析 荧光定量 糖代谢 |
Identification and Expression Analysis of Grape HXK Gene Family |
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| WANG Pingping,HUO Jianqiang,LIU Tao,LIANG Guoping,MAO Juan.Identification and Expression Analysis of Grape HXK Gene Family[J].Acta Agriculturae Boreali-Sinica,2020,35(1):57-64. |
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| Authors: | WANG Pingping HUO Jianqiang LIU Tao LIANG Guoping MAO Juan |
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