| 转录组分析不同砧木对嫁接烤烟抗青枯病的影响 |
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| 引用本文： | 谢冰,詹小旭,罗延宏,刘斌祥,孔凡磊,袁继超. 转录组分析不同砧木对嫁接烤烟抗青枯病的影响[J]. 华北农学报, 2020, 35(4): 177-186. DOI: 10.7668/hbnxb.20190870 |
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| 作者姓名： | 谢冰 詹小旭 罗延宏 刘斌祥 孔凡磊 袁继超 |
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| 作者单位： | 四川农业大学,农业农村部西南作物生理生态与耕作重点实验室,四川成都 611130;四川省烟草公司宜宾市公司,四川宜宾 611130,四川农业大学,农业农村部西南作物生理生态与耕作重点实验室,四川成都 611130,四川省烟草公司宜宾市公司,四川宜宾 611130,四川农业大学,农业农村部西南作物生理生态与耕作重点实验室,四川成都 611130,四川农业大学,农业农村部西南作物生理生态与耕作重点实验室,四川成都 611130,四川农业大学,农业农村部西南作物生理生态与耕作重点实验室,四川成都 611130 |
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| 基金项目： | 四川省烟草专卖局(公司)项目 |
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| 摘 要： | 为研究不同砧木对烟草嫁接苗抗病性的影响,明确抗病材料云烟87(Y87)作为砧木提高接穗红大金元(HD)对青枯病抗性的机理,采用劈接加生料带缠绕法以易感青枯病品种HD作为接穗,以HD和Y87作为砧木,分别构建HD/HD和HD/Y87嫁接烤烟苗,然后测量HD/HD和HD/Y87保护性酶苯丙氨酸解氨酶(PAL)活性的变化,最后利用高通量测序技术和Illumina HiSeqTM 4000测序平台,提取5株HD/HD或HD/Y87 mRNA,反转录构建总cDNA文库,测序,过滤低质量Reads后,用TopHat2比对参考基因组,用Cufflinks和DESeq软件获得基因表达量和差异表达基因。结果发现,不同取样时间HD/Y87 PAL活性均显著高于HD/HD,4个样品分别得到48 414 474～48 697 874条Clean Reads和38 272～40 938条基因,但HD/Y87发生选择性剪切事件数高于HD/HD;比较HD/Y87和HD/HD两组间基因表达量,得到3 904条差异基因,其中3 096条基因上调,808条基因下调;在上调基因中有参与木质素合成的3条编码苯丙氨酸解氨酶基因...
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| 关 键 词： | 烟草 嫁接 转录组 苯丙氨酸解氨酶 多酚氧化酶 病程相关蛋白 |
Transcriptome Analysis of the Effect of Different Rootstocks on the Resistance of Grafted Flue-cured Tobacco to Bacterial Wilt |
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| XIE Bing,ZHAN Xiaoxu,LUO Yanhong,LIU Binxiang,KONG Fanlei,YUAN Jichao. Transcriptome Analysis of the Effect of Different Rootstocks on the Resistance of Grafted Flue-cured Tobacco to Bacterial Wilt[J]. Acta Agriculturae Boreali-Sinica, 2020, 35(4): 177-186. DOI: 10.7668/hbnxb.20190870 |
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| Authors: | XIE Bing ZHAN Xiaoxu LUO Yanhong LIU Binxiang KONG Fanlei YUAN Jichao |
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