用3'RACE方法扩增并克隆口蹄疫病毒基因组3'末端序列 |
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引用本文: | 刘光清,刘在新,谢庆阁. 用3'RACE方法扩增并克隆口蹄疫病毒基因组3'末端序列[J]. 中国兽医学报, 2003, 23(6): 524-526 |
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作者姓名: | 刘光清 刘在新 谢庆阁 |
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作者单位: | 中国农业科学院,兰州兽医研究所农业部畜禽病毒学重点实验室,甘肃,兰州,730046 |
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基金项目: | 国家"973"项目(G1999011901) |
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摘 要: | 应用3’RACE方法扩增并克隆了口蹄疫病毒(FMDV)0H99株基因组3’端真实序列。测序结果表明,所扩增的目的基因片段长1500nt,包括3D基因部分序列、3’端非编码区(Non—Coding Region,NCR)和Poly(A)尾巴,其中3’NCR位于终止密码子TAA之后,长93nt,Poly(A)尾序列至少含有56个A。与参考毒株进行序列比较,结果显示,OH99株与0TY TW/97株的核苷酸同源性较高,为91.4%,而与O1K、CHINA99、A12等毒株的核苷酸同源性较低,其同源性分别为68.1%、71.0%、70.2%。3’NCR的末端存在保守性较高的基序:CCCTCAGATG,TTTTCCC—CGCTTCCT。本研究为进一步研究FMDV基因组的功能、构建OH99株的反向遗传操作系统奠定了基础。
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关 键 词: | 口蹄疫病毒 3’端非编码区 序列分析 3’RACE方法 基因克隆 同源性 3’末端序列 |
文章编号: | 1005-4545(2003)06-0524-03 |
修稿时间: | 2002-12-29 |
Molecular Cloning and Analysis of the 3' End Sequence of FMDV OH99 Strain by 3' RACE |
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Abstract: | |
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Keywords: | 3'RACE Poly(A) |
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