| 香蕉miRNA及其靶基因的生物信息学预测 |
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| 引用本文： | 彭赟,龙海飞,贺瑞,徐敏,曾灿彬,骆娟,齐钊,闫臻,阮云泽. 香蕉miRNA及其靶基因的生物信息学预测[J]. 热带生物学报, 2016, 0(2): 237-245. DOI: 10.15886/j.cnki.rdswxb.2016.02.017 |
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| 作者姓名： | 彭赟 龙海飞 贺瑞 徐敏 曾灿彬 骆娟 齐钊 闫臻 阮云泽 |
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| 作者单位： | 海南大学,农学院/海南省热带生物资源可持续利用重点实验室,海口,570228 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(31360364)，教育部热带作物新品种选育工程中心与作物学重点学科联合资助项目(lhxm-2012-2)，海南省重大科技项目(ZDZX2013023)，“中央财政支持中西部高校提升综合实力专项”子课题 |
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| 摘 要： | 利用生物信息学方法预测香蕉中的miRNA,即通过将miRBase数据库中的已知植物的miRNA与香蕉EST和GSS数据库进行BLAST比对搜索,筛选出潜在的miRNA,最后得到16条香蕉miRNA,分属于9个miRNA家族,其中3条来源于EST数据库,13条来源于GSS数据库,并利用在线软件psRNATarget预测其靶基因,共得到168个靶基因,分别编码多种功能蛋白,参与各生物学过程。
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| 关 键 词： | 香蕉 microRNA 靶基因 生物信息学分析 |
microRNA and Target Gene Prediction of Banana based on Bioinformatics |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | banana miRNA target gene bioinformatics analysis |
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