基于COⅠ序列的DNA条形码在中国南海裸胸鳝属鱼类中的应用 |
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引用本文: | 齐兴柱,骆剑,刘志亮,胡静,朱晓平,彭艳辉,尹绍武.基于COⅠ序列的DNA条形码在中国南海裸胸鳝属鱼类中的应用[J].热带生物学报,2010(4):321-326. |
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作者姓名: | 齐兴柱 骆剑 刘志亮 胡静 朱晓平 彭艳辉 尹绍武 |
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作者单位: | 海南大学海洋学院,海南大学热带生物资源教育部重点实验室,海南海口570228 |
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基金项目: | 海南省教育厅高等学校科研项目(Hjkj2010-13); 海南省自然科学基金(808122) |
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摘 要: | 为探讨中国南海裸胸鳝属(Gymnothorax)鱼类系统发育关系,采用DNA条形码技术测定了6种中国南海裸胸鳝的线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因部分序列(504bp)。结合来自GenBank中的分布于日本和3种同样分布于中国南海的裸胸鳝属鱼类的相应同源序列进行比较分析,用邻接法和最大简约法构建分子系统树。结果表明:(1)504个位点中共有187个核苷酸位点存在变异(37.1%);(2)序列变异的转换/颠换比值平均为1.5;(3)细斑裸胸鳝(Gymnothorax fimbriatus)与黑斑裸胸鳝(G.favagineus)之间的同源序列碱基差异只有0.20%,支持二者是同种异名的观点;(4)在NJ树和MP树中,蠕纹裸胸鳝和网纹裸胸鳝聚为一支,位于系统树的基部位置。其余8种聚为另外一支,然后又细分为2个较小的分支。
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关 键 词: | 裸胸鳝属 细胞色素氧化酶亚基Ⅰ基因 DNA条形码 系统树 |
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