倭竹族14-3-3非ε类基因编码区单核苷酸多态性 |
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引用本文: | 许在恩,俞瑜,李兵娟,陈虹君,郭小勤.倭竹族14-3-3非ε类基因编码区单核苷酸多态性[J].浙江农林大学学报,2016,33(1):80-87. |
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作者姓名: | 许在恩 俞瑜 李兵娟 陈虹君 郭小勤 |
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作者单位: | 1.浙江农林大学 亚热带森林培育国家重点实验室培育基地,浙江 临安 311300 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(30901155); 浙江省自然科学基金资助项目(Y307499) |
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摘 要: | 为研究倭竹族Shibataeeae中14-3-3非类基因的结构及其编码区单核苷酸多态性,分别从倭竹族5个不同属的代表种中获得14-3-3b,14-3-3c,14-3-3e,14-3-3f的基因全长。这些基因均包含5个外显子和4个内含子,编码序列(CDS)大小为771~789 bp。14-3-3b,14-3-3c,14-3-3e和14-3-3f编码区序列中分别有21,19,26和17个单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP频率分别为1SNP/38 bp,1SNP/41 bp,1SNP/30 bp,1SNP/46 bp,基因核苷酸多样性()值分别为0.012 17,0.011 83,0.015 21,0.010 38。同一基因在不同竹种间氨基酸序列一致性均达99%以上,毛竹Phyllostachys edulis Pe14-3-3b,Pe14-3-3c,Pe14-3-3e,Pe14-3-3f蛋白的理化性质非常相似,均为亲水性蛋白,含量较多的是丙氨酸(ala),谷氨酸(glu),亮氨酸(leu),等电点为4.75~4.90,这4个蛋白的二级结构也非常相似,-螺旋结构含量最高,无规则卷曲其次,-转角和延伸链很少。上述研究为进一步探索竹类植物14-3-3生物学功能奠定基础。图3表3参27
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关 键 词: | 分子遗传学 倭竹族 竹类植物 14-3-3基因家族 单核苷酸多态性 |
收稿时间: | 2015-03-04 |
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