凡纳滨对虾亲本和子一代群体的线粒体DNA遗传特征研究 |
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作者姓名: | 陈薇 马凌波 马春燕 |
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作者单位: | 1. 上海市奉贤区水产技术推广站,上海,201400;2. 中国水产科学研究院东海水产研究所,上海,200090 |
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基金项目: | 上海市现代农业(虾类)产业技术体系建设项目(沪农科产字(2014)第5号) |
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摘 要: | 对凡纳滨对虾亲本和子一代进行线粒体控制区扩增,经测序共获得53个样本(亲虾15个,子一代38个)的线粒体D-loop区序列,长为530 bp,序列有24个变异位点,总变异为4.53%,1个插入和(或)缺失位点,共13种单倍型,13个单倍型T、C、A、G的平均含量分别为48.8%、10.6%、33.6%和7.0%,(A+T)%为82.4%,远大于(G+C)%的17.6%。亲本群体与子一代群体碱基含量相同,没有差异。凡纳滨对虾亲本15个个体有5个单倍型,单倍型多样性为0.695,核苷酸多样性为0.010 26,子一代单倍型多样性为0.772,核苷酸多样性为0.01038。凡纳滨对虾亲本群体与子一代群体的遗传距离为0.001,其中亲本群体内个体间的平均遗传距离为0.0145,子一代群体内平均遗传距离为0.0120。亲本和子一代间的遗传分化系数为-0.036 44,AMOVA分析显示,变异主要来自于群体内,亲本与子一代间无分化。
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关 键 词: | 凡纳滨对虾 亲本 子一代 线粒体控制区 |
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