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十字花科植物CYP86MF同源基因的克隆及特征分析
引用本文:王玲平,曹家树,叶纨芝,向珣,余小林. 十字花科植物CYP86MF同源基因的克隆及特征分析[J]. 农业生物技术学报, 2005, 13(2): 145-151
作者姓名:王玲平  曹家树  叶纨芝  向珣  余小林
作者单位:1. 浙江大学蔬菜研究所,杭州,310029;浙江省农科院蔬菜研究所,杭州,310021
2. 浙江大学蔬菜研究所,杭州,310029
基金项目:国家自然科学基金(No.30370975)和浙江省重大科技项目(No.021102536)资助.
摘    要:用保守的特异引物进行PCR扩增,并结合RACE技术,从大白菜(Brassicacampestris L.)品种黄芽14,萝卜(Raphanus sativus L.)品种圆白和诸葛菜(Orychophrogmus violaceus)3个材料中扩增到3个完整的cDNA全长,分别命名为Bc-CYP86MF,RsCYP86MF和OvCYP86MF,它们的cDNA全长分别为1854,1818和1876bp,分别编码524,526和534个氨基酸残基。将所推导的氨基酸序列与数据库中已知基因进行排序,发现它们与拟南芥CYP86家族所有成员的氨基酸相似性都大于38%,可将它们归为细胞色素CYP86基因家族。BcCYP86MF和RsCYP86MF与CYP86C4亚家族氨基酸同源性均大于55%,则可归为CYP86C4亚家族,而OvCYP86MF与CYP86C3的同源性最高,为86.5%,应归为CYP86C3亚家族。根据氨基酸序列的排序结果构建的系统树表明,CYP450基因的氨基酸序列进化程度与物种的亲缘关系的远近相吻合。对蛋白二级结构预测结果发现,它们都具有细胞色素P450典型的保守结构域FNAGPRLCIG,而且氨基酸组成也很相似。

关 键 词:十字花科植物 特征分析 同源基因 细胞色素P450 氨基酸序列 克隆 RACE技术 氨基酸同源性 P450基因 蛋白二级结构 cDNA PCR扩增 氨基酸残基 保守结构域 氨基酸组成 特异引物 基因家族 亲缘关系 预测结果 大白菜 诸葛菜 数据库
修稿时间:2004-04-06

Cloning and Identification of CYP86MF Homologous Genes from Cruciferae
WANG Ling-Ping,CAO Jia-shu,YE Wan-zhi,XIANG Xun,YU Xiao-lin. Cloning and Identification of CYP86MF Homologous Genes from Cruciferae[J]. Journal of Agricultural Biotechnology, 2005, 13(2): 145-151
Authors:WANG Ling-Ping  CAO Jia-shu  YE Wan-zhi  XIANG Xun  YU Xiao-lin
Abstract:
Keywords:
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