小麦F-box家族基因的分类及克隆分析 |
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引用本文: | 许媛,李铃仙,王逍冬,魏春茹,赵伟全,于秀梅,刘大群. 小麦F-box家族基因的分类及克隆分析[J]. 河北农业大学学报, 2016, 0(1): 22-28. DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2016.0004 |
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作者姓名: | 许媛 李铃仙 王逍冬 魏春茹 赵伟全 于秀梅 刘大群 |
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作者单位: | 1. 河北农业大学生命科学学院,河北保定071001;河北农业大学河北省植物生理与分子病理学重点实验室,河北保定071001;2. 河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心,河北保定,071001;3. 河北农业大学生命科学学院,河北保定071001;河北省农作物病虫害生物防治工程技术研究中心,河北保定071001;河北农业大学河北省植物生理与分子病理学重点实验室,河北保定071001 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31301649),高等学校博士学科点专项科研基金(20121302120010) |
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摘 要: | 为明确小麦中F-box基因的存在种类及数量,作者通过数据库检索、编码区查找及功能结构域预测等途径,获得了NCBI和DFCI两大数据库中已报道的小麦F-box蛋白,并根据C端结构域特征对这些F-box蛋白进行了分类统计。数据库检索分类结果表明,在NCBI和DFCI数据库中共检索到符合条件的F-box基因38条,这些基因可以划分为F-box/LRR(17条,占总数的45%)、F-box/Kelch(6条,占总数的16%)和C端无明显结构域特征(15条,占总数的39%)3种类型。其中,F-box/LRR和C端无明显结构域类型所占比例较大。在此基础上,利用同源克隆策略在中国春小麦中获得了3条包含F-box结构域的序列,分别命名为Ta-SKP2A、Ta-FB和Ta-FBL14。Ta-SKP2A和Ta-FBL14属于F-box/LRR类型,Ta-FB仅包含一个F-box结构域,为C端无明显结构域类型。这些研究将为深入探讨F-box家族基因参与的小麦生物学过程及在其中的作用机理奠定基础。
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关 键 词: | 小麦 F-box家族基因 基因克隆 基因分类 |
Classification and cloning analysis of F-box family genes in wheat |
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Abstract: | |
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Keywords: | wheat F-box family genes gene cloning gene classification |
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