泰国红色原鸡和中国红色原鸡mtDNA控镀区遗传多态性和分类关系研究

对泰国红色原鸡Gallus gallus gallus亚种和中国红色原鸡Gallus gallus spadiceus亚种各16个个体mtDNAD-loop序列进行系统分析，测定线粒体D—loop部分序列大小约为560bp，A、C、G、T这4种核苷酸的平均比例分别为13．6％、43．2％、4．3％和38．9％，A＋T含量高于G＋C含量。结果共发现27个变异位点，颠换和转换之比为0．13，没有观测到插入／缺失情况。测定的6种单倍型中，2个红色原鸡亚种没有共享单倍型，单倍型多样度分别为0．250和0．695，平均核苷酸差异数分别为3．750和10．833，核苷酸多样度分别为0．954％和2．757％。泰国红色原鸡中性检验的Tajima＇s D值为-1．800（P〈O．05），不符合中性突变。2个红色原鸡亚种间核苷酸分歧度（Dxy）为2．847％，核苷酸净遗传距离（Da）为0．991％。序列群体间的方差组分（Va）占总变异的47．31％，Fst=0．473，差异极显著（P〈0．01）；群体间mtDNAD—loop Rf值也差异显著（P=0．035）。红色原鸡2个亚种具有不同的群体遗传结构，群体之间存在明显的遗传分化，本研究支持这2个亚种并非是同一个亚种的观点。