| 意大利蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的可变剪接基因分析 |
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| 引用本文： | 郭睿,陈恒,张璐,赵浩宇,熊翠玲,郑燕珍,付中民,梁勤,陈大福.意大利蜜蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫的可变剪接基因分析[J].上海交通大学学报(农业科学版),2018(3):1-6. |
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| 作者姓名： | 郭睿 陈恒 张璐 赵浩宇 熊翠玲 郑燕珍 付中民 梁勤 陈大福 |
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| 作者单位： | 福建农林大学蜂学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31702190);现代农业产业技术体系建设专项基金(CARS-44-KXJ7);福建农林大学科技创新专项基金项目(CXZX2017343);福建农林大学科技发展资金(KF2015123) |
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| 摘 要： | 为探讨可变剪接基因在宿主响应球囊菌(Ascosphaera apis)胁迫过程中的作用,基于前期已获得的意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica)幼虫肠道转录组数据进行可变剪接基因分析。在正常的意蜂4日龄幼虫肠道(AmCK),球囊菌胁迫的意蜂4、5和6日龄幼虫肠道(AmT1、AmT2、AmT3)中共鉴定出55 895个可变剪接事件,以外显子跨越和可变3′端剪接为主。各样品的共有可变剪接基因数为8 157个,AmT1、AmT2、AmT3的特有可变剪接基因数分别为207、334和542个。GO分类结果显示共有可变剪接基因分布在50个GO条目。KEGG代谢通路富集分析结果显示,共有可变剪接基因富集在290个pathway,基因富集数最多的是内质网蛋白加工、RNA运输和碳代谢。上述分析结果揭示了可变剪接基因在意蜂幼虫肠道响应球囊菌胁迫过程中的重要作用,为深入研究可变剪接基因的功能打下了基础。
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| 关 键 词： | 意大利蜜蜂 球囊菌 胁迫 可变剪接 |
| 收稿时间： | 2017/8/29 0:00:00 |
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