miR-450基因家族进化分析及其在沙子岭猪睾丸组织表达量分析 |
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引用本文: | 彭馥芝,董莲花,冉茂良,翁波,陈斌. miR-450基因家族进化分析及其在沙子岭猪睾丸组织表达量分析[J]. 经济动物学报, 2018, 0(1) |
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作者姓名: | 彭馥芝 董莲花 冉茂良 翁波 陈斌 |
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作者单位: | 湖南农业大学动物科学技术学院;畜禽遗传改良湖南省重点实验室; |
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摘 要: | 为探明miR-450基因家族(miR-450s)的系统进化历程及其在沙子岭猪睾丸组织不同发育时期表达规律。通过miRBase数据库检索miR-450s序列,利用Ensembl数据库信息确定miR-450s在不同物种中的基因组定位,采用MEGA 6.0构建miR-450基因家族的系统进化树,并利用RT-q PCR检测miR-450s在沙子岭猪睾丸组织不同发育期(E90、D1、D30、D60、D90、D120、D150、D180)的表达变化。miRBase数据库共检索15个物种36条miR-450s序列,且miR-450s序列具有高度保守性。基因组定位显示miR-450s位于X染色体上,均位于基因间隔区(Intergenic region,IGR),且miR-450基因家族成员在进化过程中紧密相连,可能由于串联重复所致。RT-q PCR结果显示,miR-450s在胚胎期中表达量显著高于出生后表达量(P0.01),且miR-450基因家族3个成员(miR-450a、miR-450b、miR-450c)在沙子岭猪睾丸不同发育阶段呈现出协同表达的特性。miR-450基因家族可能在猪睾丸组织发育过程中发挥重要调控作用。
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关 键 词: | 沙子岭猪 miR-450 进化 定量表达 |
Molecular Evolution Analysis of miR-450 Gene Family and Its Expression in Testis of Shaziling Boar |
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Abstract: | |
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