| 基于高通量测序分析驴皮肤病病灶中细菌菌群组成 |
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| 引用本文： | 樊坤,伊艳杰,刘阳,王佳奇,梁俊杰,王子朝,王雪琴,白朋勋,张慧茹.基于高通量测序分析驴皮肤病病灶中细菌菌群组成[J].动物医学进展,2019(6):37-41. |
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| 作者姓名： | 樊坤 伊艳杰 刘阳 王佳奇 梁俊杰 王子朝 王雪琴 白朋勋 张慧茹 |
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| 作者单位： | 河南工业大学生物工程学院;天津市畜牧兽医研究所 |
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| 基金项目： | 天津市科技计划项目肉驴规范养殖和疾病防控技术集成与应用(16ZXBFNC00050) |
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| 摘 要： | 驴皮具有极高的药用价值,但驴皮肤病临床发病率较高,不仅影响驴生长速度,也明显降低驴皮质量。驴皮肤病主要发生在头部和背部,临床表现为脱毛、皮屑、出血等。从天津某养殖基地采集不同症状的驴皮肤病样本37个,从中挑选6份典型皮肤病样品,采用高通量测序分析其细菌菌群组成,为研究其发病机制和防治提供基础资料。结果显示,在送检的6个样品中,发现存在4门、7纲、12目、19科、37属的细菌菌群。在属水平上,有Achromobacter、Stenotro phomonas、Pseudomonas为优势菌属,分别占总菌群的20.30%、15.00%和12.30%。通过PCoA和Venn图分析可知,皮肤出血、未出血病灶菌群组成明显不同;皮肤出血样品的菌群组成相似,Agrobacterium、Paenibacillus、Clostridium丰度较高;皮肤硬化菌群组成相似,Pantoea为主要菌群;多皮屑样品菌群组成有差异,Trichococcus是共有菌群。结果表明,引起驴皮肤病的细菌菌群组成具有明显差异,可为后期发病机制和防治提供科学依据。
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| 关 键 词： | 驴皮肤病 高通量测序 细菌菌群组成 高丰度菌群 |
Analysis of Bacterial Flora in Donkey Skin Lesions Based on High-throughput Sequencing Technolgy |
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| FAN Kun,YI Yan-jie,LIU Yang,WANG Jia-qi,LIANG Jun-jie,WANG Zi-chao,WANG Xue-qin,BAI Peng-xun,ZHANG Hui-ru.Analysis of Bacterial Flora in Donkey Skin Lesions Based on High-throughput Sequencing Technolgy[J].Progress In Veterinary Medicine,2019(6):37-41. |
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| Authors: | FAN Kun YI Yan-jie LIU Yang WANG Jia-qi LIANG Jun-jie WANG Zi-chao WANG Xue-qin BAI Peng-xun ZHANG Hui-ru |
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| Institution: | (College of Biological EngineeringHenan University of Technology,Zhengzhou,Henan,450001,China;Tianjin Institute of Animal Husbandry and Veterinary Science,Tianjin,300384,China) |
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| Abstract: | FAN Kun;YI Yan-jie;LIU Yang;WANG Jia-qi;LIANG Jun-jie;WANG Zi-chao;WANG Xue-qin;BAI Peng-xun;ZHANG Hui-ru(College of Biological EngineeringHenan University of Technology,Zhengzhou,Henan,450001,China;Tianjin Institute of Animal Husbandry and Veterinary Science,Tianjin,300384,China) |
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| Keywords: | donkey skin disease high throughput sequencing technology bacterial flora composition high dominant bacteria |
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