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牡丹休眠相关基因PsGRASs筛选、克隆和表达特性分析
引用本文:吴 红,刘春英,付祥梅,盖树鹏,张玉喜.牡丹休眠相关基因PsGRASs筛选、克隆和表达特性分析[J].园艺学报,2019,46(2):365-369.
作者姓名:吴 红  刘春英  付祥梅  盖树鹏  张玉喜
作者单位:青岛农业大学生命科学学院,山东省高校植物生物技术重点实验室,山东青岛 266109
基金项目:国家自然科学基金面上项目(31471908,31692194)
摘    要:通过筛选、克隆牡丹PsGRASs基因并进行表达模式分析,初步解析其是否参与牡丹休眠解除,以期为牡丹反季节催花提供候选基因。利用HMM(Hidden Markov Model)模型,基于GRAS基因家族的种子(Pfam号为PF03514)序列,利用BioEdit软件对牡丹花芽休眠的454测序转录组数据进行本地检索,筛选到2个具有GRAS结构域的序列。通过RACE扩增得到了其全长cDNA,其中PsGRAS1序列为2 308 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)为1 848 bp,编码615个氨基酸;PsGRAS2为2 034bp,ORF为1560bp,编码518个氨基酸,两个编码PsGRASs蛋白的同源性为19.87%。进化树结果表明,PsGRAS1蛋白与拟南芥GRAS家族中的DELLA亚家族的GAI和RGLs聚到一个大的分支,PsGRAS2蛋白与拟南芥HAMs(AtSCL6/15/22/26/27)并为一支,说明PsGRAS1和PsGRAS2来自GRAS家族的两个不同分支。组织表达结果显示PsGRAS1和PsGRAS2在牡丹初花期不同组织中表达水平不同,PsGRAS1在叶中表达水平最高,在雄蕊中最低;而PsGRAS2在苞片中表达水平最高,在花瓣中最低。在牡丹花芽休眠解除过程中,PsGRAS1呈下调趋势,低温28 d表达水平最低,而PsGRAS2呈先上调后下调趋势,低温14 d表达水平最高。在外源GA3处理7 d的牡丹花芽中,PsGRAS1的表达显著下降,而PsGRAS2显著提高。这表明PsGRAS1和PsGRAS2都参与了休眠过程,但功能不同。

关 键 词:牡丹  GRAS  休眠  赤霉素  表达模式

Screening,Cloning and Expression Patterns Analysis of PsGRASs Associated with Dormancy Release in Tree Peony(Paeonia suffruticosa)
WU Hong,LIU Chunying,FU Xiangmei,GAI Shupeng,ZHANG Yuxi.Screening,Cloning and Expression Patterns Analysis of PsGRASs Associated with Dormancy Release in Tree Peony(Paeonia suffruticosa)[J].Acta Horticulturae Sinica,2019,46(2):365-369.
Authors:WU Hong  LIU Chunying  FU Xiangmei  GAI Shupeng  ZHANG Yuxi
Institution:1. Key Laboratory of Hunan Province for Prevention and Treatment of Integrated Traditional Chinese and Western Medicine on Cardiocerebral Diseases, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China; 2. School of Nursing, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China; 3. The First Affiliated Hospital, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China; 4. School of Humanities and Management, Hunan University of Chinese Medicine, Changsha 410208, China
Abstract:
Keywords:tree peony  GRAS  dormancy  gibberellin  expression pattern
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