| 大岩桐花萼和幼叶转录组研究 |
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| 引用本文： | 费 元,韩 雪,余 红,庞基良. 大岩桐花萼和幼叶转录组研究[J]. 园艺学报, 2015, 42(12): 2519-2525. DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0105 |
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| 作者姓名： | 费 元 韩 雪 余 红 庞基良 |
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| 作者单位： | 1杭州师范大学生命与环境科学学院，杭州 310036；2杭州市农业科学研究院生物技术研究所，杭州 310024 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31071818）；浙江省重点科技创新团队项目（2010R50039） |
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| 摘 要： | 利用新一代高通量测序技术平台Illumina Solexa GAⅡx对大岩桐花萼和幼叶进行转录组测序和数据从头组装及生物信息学分析，获得了长度大于100 bp的转录物22 821条；转录本总长度28.63 Mb，N50长度1 548 bp，序列平均长度953 bp。转录物注释结果显示，15 053条有同源比对信息；7 768 条无匹配序列信息，可能为大岩桐特有的基因序列。通过对花萼、幼叶中与激素代谢、信号转导相关的差异KEGG通路比较，推断在花萼中促进生长激素合成基因的表达比幼叶中强，激素信号转导组分基因的表达也比幼叶中强。
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| 关 键 词： | 大岩桐 花萼 幼叶 转录组 生物信息学分析 |
Sequencing and Characterization of Transcriptome of Sinningia speciosa Sepals and Young Leaves |
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| FEI Yuan,HAN Xue,YU Hong,PANG Ji-liang,. Sequencing and Characterization of Transcriptome of Sinningia speciosa Sepals and Young Leaves[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2015, 42(12): 2519-2525. DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0105 |
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| Authors: | FEI Yuan HAN Xue YU Hong PANG Ji-liang |
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| Affiliation: | 1.College of Life and Environmental Sciences，Hangzhou Normal University，Hangzhou 310036，China；2Institute of Biotechnology，Hangzhou Academy of Agricultural Sciences，Hangzhou 310024，China |
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