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百香果YUCCA基因家族鉴定与表达分析
引用本文:潘佳怡,潘若云,江文洁,任锐,方庭.百香果YUCCA基因家族鉴定与表达分析[J].福建农业学报,2024(2):165-174.
作者姓名:潘佳怡  潘若云  江文洁  任锐  方庭
作者单位:福建农林大学园艺学院/福建农林大学园艺植物遗传育种研究所
基金项目:福建省自然科学基金项目(2021J05022);
摘    要:【目的】黄素单加氧酶(YUCCA)基因是吲哚-3-乙酸(Indole-3-acetic acid, IAA)生物合成的主要限速酶基因之一,在植物生长发育中起着重要调控作用。本研究利用生物信息学方法对百香果(Passiflora edulis Sims.)YUCCA基因家族成员进行鉴定,以期揭示百香果YUCCA家族基因在激素响应中的功能,同时为YUCCA家族基因在其他物种中的生物信息学研究提供参考。【方法】利用生物信息学方法分析百香果YUCCA基因编码蛋白质的理化性质和保守结构域,基因的染色体定位、基因结构、系统进化树、顺式作用元件等;利用qRT-PCR探究部分成员在植物生长调节剂IAA处理下的表达情况。【结果】百香果基因组中共鉴定出29个YUCCA家族成员,不均匀分布于8条染色体,基因长度(552~9 210 bp)存在明显差异,含有1~8个内含子,同时具有8个保守基序。通过系统进化树分析,发现百香果YUCCA基因家族可划分为3类,聚在同一分类中的百香果YUCCA基因具有高度的保守性,同时发现百香果的YUCCA基因与苜蓿(Medicago sativa L.)、拟南芥(Arabidop...

关 键 词:百香果  吲哚-3-乙酸  YUCCA基因家族  生物信息学  定量分析
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