基于转录组学分析自然感染绵羊肺腺瘤病毒患羊肺肿瘤组织中转录差异基因及病毒致瘤机制的研究

绵羊肺腺瘤病(OPA)是由绵羊肺腺瘤病毒(JSRV)引起的绵羊传染性肺肿瘤疾病。为探究JSRV对绵羊肺脏的致瘤机制，本研究从自然感染JSRV的羊(OPA患羊)肺肿瘤组织和健康羊肺组织中提取总RNA，构建二者的cDNA文库后采用Illumina Hi Seq 4000高通量测序平台进行转录组学测序(RNA-Seq)，采用DESeqR筛选健康绵羊与患病绵羊肺组织中的转录差异基因，并以P<0.05和log2(Fold change)≥1筛选转录显著差异基因。通过GO和KEGG数据库对转录显著差异基因进行GO功能和KEGG信号通路的富集分析，并采用RT-qPCR对随机选择的10个转录显著差异基因进行验证。结果显示，与对照组相比，OPA羊肺肿瘤组织中共筛选到1 360个转录上调基因和783个转录下调基因，其中154个转录显著上调基因，212个转录显著下调基因。GO功能分析显示，转录显著差异基因显著富集在178个GO条目中，包括114个生物过程(BP)、19个细胞成分(CC)和45个分子功能(MF)，主要涉及生长因子活性、复制后修复、NAD⁺二磷酸酶活性、核苷代谢过程和...