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猪流行性腹泻病毒JS2008株的传代培养及遗传变异分析
引用本文:朱琳,孙冰,孙杰,郭容利,范宝超,李彬,索朗斯珠,何孔旺.猪流行性腹泻病毒JS2008株的传代培养及遗传变异分析[J].南方农业学报,2018,49(9):1833-1840.
作者姓名:朱琳  孙冰  孙杰  郭容利  范宝超  李彬  索朗斯珠  何孔旺
作者单位:西藏农牧学院 动物科学学院,西藏 林芝 860000江苏省农业科学院 兽医研究所,南京 210014江苏省农业科学院 兽医研究所,南京,210014西藏农牧学院 动物科学学院,西藏 林芝,860000
摘    要:目的]明确猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)JS2008株的序列特征及其连续传代后的序列变化规律,为筛选出新的疫苗候选毒株提供参考依据.方法]将分离自华东地区某发病猪场的PEDV JS2008株在Vero细胞系上传代培养至100代,选取部分代次进行病毒滴度测定;每隔10代提取病毒RNA,采用RT-PCR对各代次病毒的S基因、ORF3基因和N基因进行扩增,并与PEDV经典和流行参考毒株进行序列比对及遗传变异分析.结果]PEDV JS2008株经连续传代至100代,其病毒滴度由105.5 TCID50/0.1 mL上升至107.5 TCID50/0.1 mL.JS2008株在传代过程中共有11处碱基发生突变,其中9处发生在传代培养的第10~20代,变异主要位于S基因上(7/11);同时发现JS2008株及其传代株与attenuated DR13株的相似性最高.基于S基因和N基因序列构建的PEDV系统发育进化树均表明JS2008株各代次与attenuated DR13株同处于Group 3进化群;基于ORF3基因序列构建的PEDV系统发育进化树则显示,JS2008株各代次与attenuated DR13株均处于同一进化群(Group 2).结论]PEDV JS2008株通过Vero细胞系进行体外连续传代至100代,其碱基突变主要发生在病毒传代培养的第10~20代,病毒滴度明显提高,抗原量增加,为研制新型PEDV疫苗提供可能,同时推测病毒传代培养10~20代是病毒发生变异以适应细胞培养的活跃期.

关 键 词:猪流行性腹泻病毒(PEDV)    JS2008株    传代培养    遗传变异

Passage culture and genetic variation analysis of procine epidemic diarrheal virus strain JS2008
ZHU Lin,SUN Bing,SUN Jie,GUO Rong-li,FAN Bao-chao,LI Bin,Suolang Sizhu,HE Kong-wang.Passage culture and genetic variation analysis of procine epidemic diarrheal virus strain JS2008[J].Journal of Southern Agriculture,2018,49(9):1833-1840.
Authors:ZHU Lin  SUN Bing  SUN Jie  GUO Rong-li  FAN Bao-chao  LI Bin  Suolang Sizhu  HE Kong-wang
Abstract:
Keywords:
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