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| 甘薯等10种作物基因的生物信息学分析 | |
| 作者单位： | ;1.江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/中国农业科学院农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室 |
| 摘 要： | 采用生物信息学相关软件对甘薯等10种NAC1蛋白的氨基酸序列及其理化性质、磷酸化位点、疏水性或亲水性、二级结构和三级结构、跨膜结构域、信号肽、亚细胞定位以及保守结构域等进行了预测和分析。结果表明:供试10种NAC1蛋白的磷酸化位点主要为丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸;这些NAC1蛋白均为亲水性蛋白,属于非分泌蛋白,不具有信号肽,没有明显的跨膜结构域;在它们的二级结构中,无规则卷曲所占比例最高;MtNAC1和CaNAC1可能定位于叶绿体,NtNAC1和GmNAC1可能定位于线粒体,甘薯及其他6种作物的NAC1蛋白可能定位于细胞核;甘薯等NAC1蛋白的三级结构与水稻NAC1蛋白具有一定的相似性;10种NAC1蛋白均含有1个NAM(No apical meristem)功能结构域。氨基酸序列比对和进化树分析显示IbNAC1与CaNAC1的亲缘关系最近。 |
| 关 键 词： | 甘薯 NAC1 生物信息学 功能结构域 亚细胞定位 基因 |
Bioinformatics Analysis of NAC1 Gene in Ten Crops Including Sweet Potato |
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| Abstract: | |
| Keywords: | |
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