| 铁皮石斛鲨烯合酶基因的克隆及其组织表达模式分析 |
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| 引用本文： | 张 岗,唐志书,周莉英.铁皮石斛鲨烯合酶基因的克隆及其组织表达模式分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2013,41(9):151-158. |
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| 作者姓名： | 张 岗 唐志书 周莉英 |
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| 作者单位： | 陕西中医学院 药学院/陕西省中药基础与新药研究重点实验室;陕西中医学院 药学院/陕西省中药基础与新药研究重点实验室;陕西中医学院 药学院/陕西省中药基础与新药研究重点实验室 |
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| 基金项目： | 教育部科学技术研究重点项目（211177）；陕西省科技计划青年科技新星项目(2012KJXX-44)；陕西省自然科学基础研究计划项目（2011JQ4016）；陕西省教育厅专项科研计划项目（2013JK0829） |
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| 摘 要： | 【目的】克隆珍稀濒危兰科药用植物铁皮石斛(Dendrobium officinale Kimura et Migo)鲨烯合酶(Squalene synthase,SS)基因(DoSS),并对其进行生物信息学与组织表达模式分析,为研究其生物学功能提供参考。【方法】采用RT-PCR和RACE技术,获得DoSS基因全长序列;利用生物信息学软件预测DoSS蛋白的理化性质、结构域及亚细胞定位等分子特性;用DNASTAR 6.0和MEGA 4.0分别进行DoSS蛋白氨基酸多序列比对和进化关系分析;借助qPCR检测DoSS基因的组织表达模式。【结果】成功克隆获得铁皮石斛鲨烯合酶基因,命名为DoSS(GenBank注册号JX272631),其cDNA全长1 735bp,编码一条由410个氨基酸组成的多肽,分子质量46.99ku,等电点7.13;DoSS蛋白含有鲨烯/八氢番茄红素合成酶保守结构域(44-315位氨基酸);DoSS与其他多种植物SS基因的编码蛋白同源性很高(61%~75%),与水稻、玉米等单子叶植物的亲缘关系较近;DoSS基因为组成型表达,在根中的表达量最大,为叶的12.41倍;茎次之,为叶的1.87倍。【结论】成功克隆得到1个鲨烯合酶基因(DoSS)全长cDNA;DoSS基因的(在根中高)表达特征暗示,其可能在铁皮石斛根的生长发育中发挥重要的调控功能。
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 鲨烯合酶 基因克隆 表达模式 结构域 萜类 |
| 收稿时间： | 2012/11/14 0:00:00 |
Characterization of a squalene synthase gene in Dendrobium officinale Kimura et Migo |
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| Institution: | ZHANG Gang;TANG Zhi-shu;ZHOU Li-ying;LIU Qing;LI Yi-min;ZHANG Xiao-fei;Lü Xin;College of Pharmacy and Shaanxi Provincial Key Laboratory for Chinese Medicine Basis & New Drugs Research,Shaanxi University of Chinese Medicine;College of Food Science and Engineering,Northwest A&F University; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dendrobium officinale Kimura et Migo squalene synthase gene cloning expression pattern domain terpenoid |
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