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2010-2012年陕西地区猪圆环病毒2型分子流行病学调查
引用本文:邵 萌,吕亚辉,杜 谦. 2010-2012年陕西地区猪圆环病毒2型分子流行病学调查[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2013, 41(10): 19-26
作者姓名:邵 萌  吕亚辉  杜 谦
作者单位:西北农林科技大学 动物医学院;西北农林科技大学 动物医学院;西北农林科技大学 动物医学院
基金项目:西北农林科技大学基本科研业务费项目(QN2011064);西北农林科技大学引进人才启动项目(Z111021103)
摘    要:【目的】调查陕西地区猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)的分子流行病学变化趋势,为进一步预防和治疗猪圆环病毒病提供参考。【方法】于2010-2012年采集陕西西安、咸阳、宝鸡、榆林和延安等地区发病猪群中的141份样品。首先,采用PCR检测样品中PCV2感染情况;然后,通过基因型特异的PCR,检测PCV2阳性样品中PCV2a和PCV2b亚型的感染情况;最后,扩增、克隆和测序PCV2 ORF2基因编码序列,并通过生物信息学软件统计分析所获得基因序列的进化情况。【结果】141份样品中,117份检测为PCV2阳性,阳性率达82.9%,其中的33份病死猪样品中有32份检测为PCV2阳性。基因型特异的PCR检测结果显示,117份PCV2阳性样品中单感染PCV2b的为59份,单感染PCV2a的为11份,另外47份样品为PCV2a和PCV2b混合感染。对32份病死猪PCV2阳性样品的PCV2 ORF2基因序列进行比对分析,结果表明,12份为PCV2b-1A/1B亚型,16份为PCV2b-1C亚型,4份为PCV2a亚型。对各亚型ORF2氨基酸序列的分析结果表明,氨基酸的变异位点主要存在于8-47,59-101,134-169,180-210这4个区域。【结论】陕西地区猪群PCV2感染严重,并且PCV2b-1A/1B和PCV2b-1C亚型是主要流行毒株,氨基酸变异位点主要存在于Cap蛋白潜在表位区。

关 键 词:猪圆环病毒2型  PCV2a  PCV2b  ORF2  序列分析  流行株
收稿时间:2012-12-10

Molecular epidemiological investigation on porcine circovirus type 2 in Shaanxi Province during 2010-2012
SHAO Meng;L Ya-hui;DU Qian;SHI Le;HUANG Yong;TONG De-wen. Molecular epidemiological investigation on porcine circovirus type 2 in Shaanxi Province during 2010-2012[J]. Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition), 2013, 41(10): 19-26
Authors:SHAO Meng  L Ya-hui  DU Qian  SHI Le  HUANG Yong  TONG De-wen
Affiliation:SHAO Meng;L Ya-hui;DU Qian;SHI Le;HUANG Yong;TONG De-wen;College of Veterinary Medicine,Northwest A&F University;
Abstract:
Keywords:PCV2  PCV2a  PCV2b  ORF2  sequence analysis  epidemic strains
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