| 毛竹CesA基因鉴定及其表达调控研究 |
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| 引用本文： | 王新悦,朱成磊,杨克彬,李广柱,李真,袁婷婷,高志民.毛竹CesA基因鉴定及其表达调控研究[J].核农学报,2022,36(4):706-715. |
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| 作者姓名： | 王新悦 朱成磊 杨克彬 李广柱 李真 袁婷婷 高志民 |
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| 作者单位： | 国际竹藤中心竹藤资源基因科学与基因产业化研究所,国家林业和草原局/北京市共建竹藤科学与技术重点实验室,北京 100102 |
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| 基金项目： | 国际竹藤中心基本科研业务费专项资金项目(1632020004);林业公益性行业科研专项重大项目(201504106) |
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| 摘 要： | 纤维素合成酶(CesA)是纤维素合成的关键酶。为探究毛竹(Phyllostachys edulis)中CesA基因的分子特征、表达模式及其调控关系,本研究采用生物信息学方法对毛竹CesA基因家族成员进行系统分析,基于毛竹RNA-Seq数据和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析CesA在毛竹组织中的表达模式,借助酵母单杂交技术验证转录因子MYB对CesA的调控作用。结果表明,在毛竹中共鉴定21个CesA(PeCesA1~PeCesA21),分别含有8~14个内含子;共线性分析发现19个PeCesAs存在片段复制,且Ka/Ks值均小于1.0。PeCesAs编码蛋白长度为904~1 093 aa,分子量在101.10~123.63 kDa之间,理论等电点为5.95~8.60;亚细胞定位预测所有PeCesAs都定位在质膜上;保守基序分析发现,PeCesAs共含有20个保守基序,均含有CesA家族的特征基序D、D、D和QxxRW。系统发育分析结果表明,毛竹等4个物种的CesA家族52个成员聚类成7个分支。RNA-Seq数据分析结果表明,PeCesAs(PeCesA1/5/10/11/17)在根以及不同高度笋的中部和基部的表达量存在明显差异,而且PeMYB35和PeMYB37均与PeCesA1/5/10/11/17存在较强的共表达关系。qRT-PCR结果进一步证实,随着毛竹笋高度的增加,PeMYB35与PeCesA1/5/10/11/17呈现相似的表达趋势。此外,PeCesA1/5/10/11/17的启动子序列中均包含MYB转录因子的结合位点GAMYB,酵母单杂结果证实PeMYB35能够与PeCesA1启动子中GAMYB元件相结合,可能会进一步调控基因的表达。该结果为研究毛竹中纤维素的生物合成机制提供了参考依据。
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| 关 键 词： | 毛竹 纤维素合成酶基因 表达模式分析 转录调控 |
| 收稿时间： | 2021-05-18 |
Identification and Expression Regulation of CesA Genes in Moso Bamboo |
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| WANG Xinyue,ZHU Chenglei,YANG Kebin,LI Guangzhu,LI Zhen,YUAN Tingting,GAO Zhimin.Identification and Expression Regulation of CesA Genes in Moso Bamboo[J].Acta Agriculturae Nucleatae Sinica,2022,36(4):706-715. |
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| Authors: | WANG Xinyue ZHU Chenglei YANG Kebin LI Guangzhu LI Zhen YUAN Tingting GAO Zhimin |
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| Institution: | International Center for Bamboo and Rattan, Institute of Gene Science and Industrialization for Bamboo and Rattan Resources Key Laboratory of National Forestry and Grassland Administration/Beijing for Bamboo & Rattan Science and Technology, Beijing 100102 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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