| 基于全基因组重测序筛选绵羊经济性状候选基因 |
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| 引用本文： | 李旭静,张配颖,锡建中,周营,陈晓勇,王建涛,周荣艳. 基于全基因组重测序筛选绵羊经济性状候选基因[J]. 中国畜牧杂志, 2022, 0(2): 59-64 |
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| 作者姓名： | 李旭静 张配颖 锡建中 周营 陈晓勇 王建涛 周荣艳 |
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| 作者单位： | 河北农业大学动物科技学院;唐山市畜牧工作站 |
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| 基金项目： | 河北农业大学精准畜牧学科群建设项目(1090064)。 |
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| 摘 要： | 本文旨在通过全基因组重测序筛选绵羊经济性状有关的候选基因。利用小尾寒羊和萨福克羊各9个个体全基因组数据进行分析,计算群体分化指数(Fst)进行选择信号分析,对受选择区域进行基因注释和富集分析。共筛选出391个受选择区域(top5%ZFst值);基因本体富集(GO)分析显示,受选择的区域基因主要与G蛋白偶联的嘌呤核苷酸受体的活性和G蛋白偶联的核苷酸受体的活性有关(P<0.01);KEGG通路分析结果表明,这些基因显著富集在嗅觉传导、花生四烯酸代谢和系统性红斑狼疮信号通路(P<0.01)。ZFst值大于5的选择信号区域有51个(89个基因),其中注释到46个基因与生长发育、疾病和抗病、适应性、乳品质、生殖、毛和被毛颜色性状有关。研究结果为深入研究绵羊的经济性状形成的遗传基础和进行绵羊遗传改良提供科学依据。
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| 关 键 词： | 选择信号 绵羊 经济性状 群体分化指数(Fst) 候选基因 |
Screening of Candidate Genes Related to Economic Traits Based on Whole Genome Resequencing in Sheep |
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| LI Xujing,ZHANG Peiying,XI Jianzhong,ZHOU Ying,CHEN Xiaoyong,WANG Jiantao,ZHOU Rongyan. Screening of Candidate Genes Related to Economic Traits Based on Whole Genome Resequencing in Sheep[J]. Chinese Journal of Animal Science, 2022, 0(2): 59-64 |
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| Authors: | LI Xujing ZHANG Peiying XI Jianzhong ZHOU Ying CHEN Xiaoyong WANG Jiantao ZHOU Rongyan |
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| Affiliation: | (College of Animal Science and Technology,Hebei Agricultural University,Hebei Baoding 071001,China;Animal Husbandry Workstation in Tangshan,Hebei Tangshan 063001,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Selective signature Sheep Economic traits Candidate genes Population differentiation index Fst |
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