| 大豆OPR基因家族全基因组鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 王艳微,王敏,王江,张庆祝,解莉楠. 大豆OPR基因家族全基因组鉴定与表达分析[J]. 大豆科学, 2022, 41(2): 129-139. DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2022.02.0129 |
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| 作者姓名： | 王艳微 王敏 王江 张庆祝 解莉楠 |
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| 作者单位： | 东北林业大学生命科学学院/东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室,黑龙江哈尔滨150040,东北林业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨150040;东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,黑龙江哈尔滨150040 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目(31871220,31801444)；;黑龙江省自然科学基金联合引导项目(LH2021C005)；;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(CAFYBB2019ZY003)；;中央高校基本科研业务费专项资金(2572020DP01)； |
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| 摘 要： | 为了揭示大豆12-氧-植物二烯酸还原酶(12-oxo-phytodienoic acid reductase, OPR)家族成员GmOPRs在大豆生长发育中和非生物胁迫下发挥的作用，本研究运用生物信息学方法进行大豆OPR基因家族全基因组鉴定及表达分析。结果显示：大豆基因组中共有12个OPR家族基因成员，分布在8条不同染色体上。系统发育进化分析、基因结构分析和保守基序分析结果显示，GmOPRs可分为两个亚组，含有外显子4～5个，内含子3～5个，GmOPR蛋白之间保守基序分布相似。共线性分析鉴定表明共有4对基因存在共线关系，均为片段复制。GmOPRs启动子区域含有响应厌氧、干旱和低温等非生物胁迫以及JA、ABA等多种激素的顺式作用元件。不同的大豆品种及不同的组织中，GmOPRs的表达模式有差异。GmOPR1、GmOPR4和GmOPR9受干旱胁迫影响后表达量下降，GmOPR7、GmOPR8、GmOPR11和GmOPR12随着盐胁迫影响时间的增长表达量增加，表明GmOPRs基因通过多种表达模式响应干旱和盐胁迫。GmOPRs在系统发育进化和基因结构上比较保守，基因家族数量的扩增主要归因于片段重复...
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| 关 键 词： | 大豆 OPR基因家族 非生物胁迫 表达分析 生物信息学分析 |
Genome-wide Identification and Expression Analysis of Soybean OPR Gene Family |
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| WANG Yan-wei,WANG Min,WANG Jiang,ZHANG Qing-zhu,XIE Li-nan. Genome-wide Identification and Expression Analysis of Soybean OPR Gene Family[J]. Soybean Science, 2022, 41(2): 129-139. DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2022.02.0129 |
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| Authors: | WANG Yan-wei WANG Min WANG Jiang ZHANG Qing-zhu XIE Li-nan |
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