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马铃薯StASR基因的生物信息学分析及基因克隆
引用本文:王树林,李高峰,张荣,文国宏,李建武.马铃薯StASR基因的生物信息学分析及基因克隆[J].甘肃农业科技,2022,53(3):20-24.
作者姓名:王树林  李高峰  张荣  文国宏  李建武
作者单位:甘肃省农业科学院马铃薯研究所,甘肃 兰州 730070;国家农业科学种质资源渭源观测实验站,甘肃 渭源 748201
基金项目:国家自然科学基金资助项目(31760410);
摘    要:将拟南芥AtASR基因核苷酸序列作为查询序列,在NCBI数据库中进行BLAST比对,得到马铃薯StASR基因(GenBank登录号:XM_006359742)的序列。通过生物信息学分析发现,该基因位于4号染色体上,基因长度为654 bp,编码108个氨基酸残基,其编码的蛋白质具有典型的ABA/WDS保守结构域。启动子区域分析后发现,马铃薯StASR基因含有水分响应元件MYCATERD1、冷胁迫响应元件DRECRTCOREAT和盐胁迫响应元件GT1GMSCAM4等多种与非生物胁迫响应相关元件以及马铃薯生长发育相关顺式作用元件,对其进行蛋白质互作网络的分析发现与低温、水分胁迫等基因互作。用PCR技术成功的克隆到马铃薯StASR基因,其结果可以为深入研究马铃薯StASR基因的功能提供基础。

关 键 词:ASR基因  干旱胁迫  马铃薯  生物信息学

Bioinformatics Analysis and Cloning of the StASR Gene in Solanum tuberosum
WANG Shulin,LI Gaofeng,ZHANG Rong,WEN Guohong,LI Jianwu.Bioinformatics Analysis and Cloning of the StASR Gene in Solanum tuberosum[J].Gansu Agricultural Science and Technology,2022,53(3):20-24.
Authors:WANG Shulin  LI Gaofeng  ZHANG Rong  WEN Guohong  LI Jianwu
Abstract:
Keywords:
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