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一种土壤微生物总DNA的高效提取方法
引用本文:黄婷婷,曹慧,王兴祥,崔中利.一种土壤微生物总DNA的高效提取方法[J].土壤,2004,36(6):662-666.
作者姓名:黄婷婷  曹慧  王兴祥  崔中利
作者单位:1. 南京农业大学农业部环境微生物工程重点开放实验室,南京,210095
2. 中国科学院南京土壤研究所,南京,210008
3. 南京农业大学农业部环境微生物工程重点开放实验室,南京,210095;中国科学院南京土壤研究所,南京,210008
基金项目:国家自然科学基金项目(40371069),中国博士后科学基金项目(2003033495),中国科学院创新项目( KZCX3-SW-417)资助。
摘    要:获得高浓度、大片段、多样性程度高的土壤微生物总DNA 是研究土壤微生物群落结构的分子生态学基础。本文采用间接法(菌体细胞回收法)提取红壤地区两种土壤类型的土壤微生物总DNA,定量计算其回收率,并与直接法(细胞原位裂解法)比较了提取效率和纯度。结果表明:红壤地区2种土壤每克干土的总DNA提取量,间接法约为0.34和0.53礸/g干土,直接法约为13.62和24.32礸/g干土;间接法的提取效率低于直接法,但所得DNA片段较大,且Sau 3AⅠ 酶切和16 S rDNA通用引物PCR扩增结果显示,间接法比直接法更能有效地去除土壤中的某些抑制剂,所得总DNA的纯度更高,有利于后续操作。

关 键 词:土壤微生物  总DNA提取  细胞回收  粗DNA纯化

AN EFFICIENT METHOD FOR DNA EXTRACTION FROM SOIL MICROORGANISM
HUANG Ting-ting,CAO Hui,WANG Xing-xiang and CUI Zhong-li.AN EFFICIENT METHOD FOR DNA EXTRACTION FROM SOIL MICROORGANISM[J].Soils,2004,36(6):662-666.
Authors:HUANG Ting-ting  CAO Hui  WANG Xing-xiang and CUI Zhong-li
Institution:Key Laboratory of Microbiologial Engineering of Agricultural Enviroment, MOA, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095,Key Laboratory of Microbiologial Engineering of Agricultural Enviroment, MOA, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095,Institute of Soil Science, Chinese Acedemy of Sciences, Nanjing 210008 and Key Laboratory of Microbiologial Engineering of Agricultural Enviroment, MOA, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095;Institute of Soil Science, Chinese Acedemy of Sciences, Nanjing 210008
Abstract:
Keywords:Soil microorganism  DNA extraction  Cell re covery method  Crude DNA purification
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