| 野生蕉ω-3脂肪酸去饱和酶基因FAD7密码子偏性分析 |
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| 引用本文： | 赖志宸,林玉玲.野生蕉ω-3脂肪酸去饱和酶基因FAD7密码子偏性分析[J].福建农业学报,2017,32(5). |
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| 作者姓名： | 赖志宸 林玉玲 |
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| 作者单位： | 1. 电子科技大学计算机科学与工程学院,四川 成都 611731;福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建 福州 350002;2. 福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建 福州,350002 |
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| 基金项目： | 福建省科技重大专项，国家香蕉产业技术体系建设专项 |
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| 摘 要： | 为了解FAD7的密码子使用特性,试验采用CodonW、SPSS19.0、MEGA5.0等软件和EMBOSS在线程序对野生蕉FAD7密码子偏性进行分析,同时与其他单/双子叶植物FAD7和模式生物基因组进行比较。结果显示,野生蕉FAD7密码子偏性水平较弱,密码子组成和结尾偏好使用G或C,而CUC、CAG和AGG等在该基因中具有较高的使用频率;物种间FAD7比较结果发现,单子叶植物FAD7密码子组成明显偏好G或C,而双子叶植物则完全相反;基于密码子使用频率FAD7聚类结果与CDS分类结果一致,均能将单/双子叶植物区分开来;此外,大肠杆菌原核表达受体系统可作为野生蕉FAD7基因异源表达理想试验体系。研究结果为野生蕉FAD7后续结构和功能研究提供了科学依据。
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| 关 键 词： | 野生蕉 密码子偏性 ω-3脂肪酸去饱和酶 聚类分析 |
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