| 锦鲤疱疹病毒-CJ株ORF81基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 周井祥,李新伟,王好,吕文亮,朱霞.锦鲤疱疹病毒-CJ株ORF81基因的克隆及生物信息学分析[J].水产学报,2011,35(12):1780-1786. |
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| 作者姓名： | 周井祥 李新伟 王好 吕文亮 朱霞 |
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| 作者单位： | 吉林农业大学动物科技学院,动物生产及产品质量安全教育部重点实验室,吉林长春130118 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(30671621) |
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| 摘 要： | 为了解锦鲤疱疹病毒中国吉林株(KHV-CJ) ORF81蛋白的结构特征和进化关系,用框镜鲤尾鳍原代细胞增殖KHV-CJ,提取其DNA,经PCR扩增,获得ORF81基因,将其克隆到pMD18-T载体中,构建重组质粒.应用生物信息学方法初步分析KHV-CJ ORF81基因的结构和功能,并与GenBank上已公布的3株KHV构建系统进化树.结果显示,获得了长771 bp的ORF81基因,编码256个氨基酸；预测ORF81基因的理论分子量为28 246.50 u,等电点为8.404；疏水性大于亲水性；信号肽切割部位最可能位于29位的S(丝氨酸)；有4个跨膜区；抗原表位预测显示抗原性良好；结构预测显示,不存在N-糖基化位点、存在6个O-糖基化位点和11个磷酸化位点；系统进化树分析显示,与锦鲤疱疹病毒以色列株属同一分支.
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| 关 键 词： | 锦鲤疱疹病毒 ORF81基因 克隆测序 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2011/7/15 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2011/9/14 0:00:00 |
Cloning and bioinformatics analysis of ORF81 gene of koi herpesvirus-CJ strain |
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| ZHOU Jing xiang,LI Xin wei,WANG Hao,LV Wen liang and ZHU Xia.Cloning and bioinformatics analysis of ORF81 gene of koi herpesvirus-CJ strain[J].Journal of Fisheries of China,2011,35(12):1780-1786. |
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| Authors: | ZHOU Jing xiang LI Xin wei WANG Hao LV Wen liang and ZHU Xia |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | koi herpesvirus ORF81 gene cloning and sequencing bioinformatics analysis |
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