| 基于全长转录组测序的掌叶大黄bZIP基因家族鉴定分析 |
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| 作者姓名： | 唐璟 杜桥 胡晓晨 李依民 高静 彭亮 张岗 |
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| 作者单位： | 1. 陕西中医药大学药学院/陕西省秦岭中草药应用开发工程技术研究中心;2. 陕西中医药大学省部共建特色秦药资源研究开发国家重点实验室(培育);3. 陕西中医药大学陕西省中医药管理局“秦药”研发重点实验室 |
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| 摘 要： | bZIP转录因子在调控植物生长发育、次生代谢产物合成以及胁迫响应中发挥着重要作用。本研究基于全长转录组测序分析，系统筛选掌叶大黄(Rheum palmatum) bZIP基因家族，分析其编码蛋白的理化性质、保守基序及系统进化等特性，利用RNA-seq进行基因组织表达分析和茉莉酸甲酯(MeJA)处理基因表达分析。结果表明，掌叶大黄bZIP基因家族有63个成员(RpbZIP1～RpbZIP63)；根据其与拟南芥(Arabidopsis thaliana) bZIP系统发育关系被分为A～I和K、S等11个亚族；RpbZIPs基因主要编码不稳定的亲水蛋白，均定位于细胞核；RpbZIPs蛋白二级结构主要为α螺旋和无规卷曲。基于RNA-seq数据，筛选出掌叶大黄根及根茎中高表达且响应MeJA的RbZIP16、RpbZIP17、RpbZIP61等6个基因，qPCR验证了其中4个与转录组测序表达结果一致。本研究系统分析掌叶大黄bZIP基因家族，为后续进一步研究基因功能及大黄次生代谢转录调控机制提供了科学依据。
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| 关 键 词： | 基因表达 茉莉酸甲酯 系统进化分析 大黄 转录因子 |
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