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赤琥珀螺线粒体全基因组测定与系统发育关系的研究
引用本文:马 蕊,张卫红,郭阳阳.赤琥珀螺线粒体全基因组测定与系统发育关系的研究[J].西北农业学报,2024(1):175-182.
作者姓名:马 蕊  张卫红  郭阳阳
作者单位:(新疆大学 生命科学与技术学院,新疆生物资源基因工程重点实验室,乌鲁木齐 830017)
基金项目:新疆维吾尔自治区科技计划(2020D01C043)。
摘    要:旨在通过高通量测序技术获得赤琥珀螺(Succinea erythrophana)线粒体基因组全序列,对其结构及组成特征进行分析,并结合NCBI数据库已公布的琥珀螺科及柄眼目物种序列,以最大似然法和贝叶斯法分别进行系统发育分析。结果显示:①赤琥珀螺线粒体基因组全长 14 023 bp(GenBank No.ON533899),由37个基因和一段富含AT的非编码控制区组成,有20处基因间隔,13处基因重叠。A+T平均含量为77.3%,表现出明显的AT偏向性。基因的排列顺序、结构与组成、密码子使用情况与琥珀螺科已报道种类相似。 ②除tRNA-PhetRNA-HistRNA-Ser1tRNA-Ser2外,其余 tRNAs呈典型三叶草结构。③Ka/Ks选择压力分析显示其受到纯化选择作用。④系统发育研究揭示赤琥珀螺与同属的腐败琥珀螺(Succinea putris)亲缘关系最近,然后与同科其他物种形成姐妹群关系。

关 键 词:赤琥珀螺  琥珀螺科  线粒体基因组  系统发育

Complete Mitochondrial Genome Sequencing and Phylogeny Analysis of Succinea erythrophana
MA Rui,ZHANG Weihong and GUO Yangyang.Complete Mitochondrial Genome Sequencing and Phylogeny Analysis of Succinea erythrophana[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2024(1):175-182.
Authors:MA Rui  ZHANG Weihong and GUO Yangyang
Abstract:
Keywords:
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