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小麦3种锈菌PCWDEs家族基因鉴定及表达分析
引用本文:吴珂妍,千慧敏,赵俊溢,李闯,路亚南,邢国珍,刘娜,郑文明. 小麦3种锈菌PCWDEs家族基因鉴定及表达分析[J]. 中国农业大学学报, 2024, 0(4): 113-127
作者姓名:吴珂妍  千慧敏  赵俊溢  李闯  路亚南  邢国珍  刘娜  郑文明
作者单位:1.河南农业大学 生命科学学院,郑州 450002;2.省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室,郑州 450002
基金项目:国家重点研发计划(2021YFD1401000); 河南省重大科技专项(221100110100); 河南农业大学拔尖人才项目(30500924)
摘    要:为挖掘小麦锈菌侵染过程中发挥关键作用的植物细胞壁降解酶(Plant cell wall-degrading enzymes,PCWDEs)基因,通过生物信息学方法对小麦3种锈菌(叶锈菌、条锈菌和秆锈菌)基因组中的碳水化合物活性酶(Carbohydrate-active enzymes, CAZymes)进行预测分析,在此基础上对其中的PCWDEs基因家族进行全基因组范围的筛选鉴定,并利用qRT-PCR方法对叶锈菌PCWDEs家族成员在侵染过程中的转录水平进行了检测分析。结果表明:1)小麦叶锈菌、条锈菌和秆锈菌基因组分别编码355、322和345个CAZymes家族成员基因以及160、153和158个PCWDEs基因;小麦3种锈菌共含75个保守CAZymes基因亚家族和94个PCWDEs直系同源基因簇。2)16个叶锈菌特异性PCWDEs基因在亲和(Pt15-‘中国春’)/非亲和(Pt15-‘云麦34’)互作过程中均受到不同程度的诱导表达,但非亲和互作中在侵染更早期就已受到诱导上调表达。3)叶锈菌特异性PCWDEs基因簇中有4个PCWDEs被鉴定为类扩展蛋白,其在侵染过程中受到诱导表达,说...

关 键 词:小麦锈菌  PCWDEs  生物信息学分析  qRT-PCR  侵染机制
收稿时间:2023-11-13

Identification and expression analysis of PCWDEs family genes in three wheat rust fungi
WU Keyan,QIAN Huimin,ZHAO Junyi,LI Chuang,LU Ya’nan,XING Guozhen,LIU N,ZHENG Wenming. Identification and expression analysis of PCWDEs family genes in three wheat rust fungi[J]. Journal of China Agricultural University, 2024, 0(4): 113-127
Authors:WU Keyan  QIAN Huimin  ZHAO Junyi  LI Chuang  LU Ya’nan  XING Guozhen  LIU N  ZHENG Wenming
Affiliation:1.College of Life Sciences, Henan Agricultural University, Zhengzhou 450002, China;2.State Key Laboratory of Wheat and Maize Crop,Zhengzhou 450002, China
Abstract:
Keywords:wheat rust fungi  PCWDEs  bioinformatics  qRT-PCR  pathogenic mechanism
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