| 小麦籽粒镉元素含量全基因组关联分析及候选基因预测 |
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| 引用本文： | 王健胜,时 夏,周正富,马爱锄,王二伟,侯桂玲,晁岳恩,李文旭,王亚欢,吴政卿,雷振生.小麦籽粒镉元素含量全基因组关联分析及候选基因预测[J].西北农业学报,2024(1):29-38. |
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| 作者姓名： | 王健胜 时 夏 周正富 马爱锄 王二伟 侯桂玲 晁岳恩 李文旭 王亚欢 吴政卿 雷振生 |
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| 作者单位： | (1.平顶山学院 化学与环境工程学院，河南平顶山 467000；2. 河南省作物分子育种研究院，郑州 450002；3.平顶山市农科院，河南平顶山 467001；4. 河南省生态经济型木本植物种质创新与利用重点实验室，河南平顶山 467000) |
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| 基金项目： | 国家自然基金委-河南省人民政府联合基金(U1804102)；河南省科技攻关计划(202102110027)；河南省农业科学院杰出青年项目（2020YQ02）。 |
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| 摘 要： | 以国内外207份小麦种质为材料，利用660K SNP芯片对其进行基因型检测，并结合不同环境下表型数据和最佳线性无偏预测值 (BLUP，Best linear unbiased prediction) 对小麦籽粒镉元素含量进行全基因组关联分析。结果表明：与小麦籽粒镉元素含量显著关联的SNP 310个，这些SNP分布于除3D和4D外的19条染色体上，单个SNP解释变异率为10.95%～14.66%。不同环境下检测到的关联SNP结果存在差异，其中在原阳地区检测到186个SNP，开封地区检测到71个SNP。基于BLUP值分析获得53个SNP。基于SNP物理位置，将距离较近的SNP进行整合，共获得有效QTL位点52个。同时发现了7个在多环境下表现稳定的SNP，并对其进行单标记效应分析。最后对基于获得的关联SNP进行了候选基因预测，共获得7个与小麦籽粒镉元素含量相关的候选基因，其中 TraesCS1B01G321700和TraesCS1B01G320200可能与镉元素调控相关基因转录有关，而TraesCS7B01G459000和TraesCS7B01G456900可能与镉元素的吸收和转运等代谢过程有关。还筛选出了对镉具有良好避性的部分小麦优异种质，如‘云麦51’‘郑麦379’‘白穗白’‘云麦53’‘双丰收’。
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| 关 键 词： | 小麦 Cd含量 SNP芯片 全基因组关联分析 |
Genome-Wide Association Analysis and Candidate Gene Prediction of Wheat Grain Cd Concentration |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Wheat Cd concentration SNP array Genome-wide association analysis |
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