薄壳山核桃CiSPL2基因克隆、亚细胞定位及表达分析 |
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引用本文: | 王敏,席东,莫正海,张仕杰,朱灿灿.薄壳山核桃CiSPL2基因克隆、亚细胞定位及表达分析[J].南方农业学报,2024(1):47-56. |
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作者姓名: | 王敏 席东 莫正海 张仕杰 朱灿灿 |
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作者单位: | 1. 江苏省中国科学院植物研究所;2. 上海市农业科学院园艺研究所;3. 上海市青浦区农业技术推广服务中心 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(32001350);;江苏省自然科学基金项目(BK20210166)~~; |
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摘 要: | 【目的】克隆薄壳山核桃SQUAMOSA启动子结合蛋白(SPL)转录因子基因CiSPL2,并对其进行亚细胞定位及表达分析,为探究该基因在薄壳山核桃雌花发育过程的分子机制提供理论依据。【方法】根据薄壳山核桃基因组数据,采用RT-PCR方法克隆CiSPL2基因编码区(CDS)序列,利用生物信息学软件分析其序列特征和蛋白理化性质,构建pCAMBIA1300-CiSPL2-GFP融合表达载体,瞬时转化烟草后观察荧光信号确定亚细胞定位情况。基于转录组数据和实时荧光定量PCR检测CiSPL2基因在不同组织及不同雌花芽分化时期的表达模式。【结果】薄壳山核桃CiSPL2基因CDS长度为1398 bp,共编码465个氨基酸残基,相对分子量为51.78 kD,理论等电点(p I)为8.28,不稳定系数为49.89,脂肪酸氨基酸指数为64.62,平均亲水性平均值(GRAVY)为-0.617,为不稳定的亲水性蛋白,含有SBP结构域(位于第183~257位氨基酸),亚细胞定位于细胞核。CiSPL2蛋白的二级结构主要由α-螺旋(17.42%)、延伸链(13.55%)、β-转角(1.72%)和无规则卷曲(67.31%...
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关 键 词: | 薄壳山核桃 CiSPL2基因 系统发育分析 亚细胞定位 基因表达 |
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