| 二穗短柄草WRKY基因家族成员的鉴定和分析 |
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| 引用本文： | 蒋 明,尹龙飞,张志仙,余沁欣,罗礼礼. 二穗短柄草WRKY基因家族成员的鉴定和分析[J]. 麦类作物学报, 2012, 32(6): 1013-1020 |
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| 作者姓名： | 蒋 明 尹龙飞 张志仙 余沁欣 罗礼礼 |
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| 作者单位： | 1. 台州学院生命科学学院,浙江临海,317000
2. 台州市农业科学研究院,浙江临海,317000 |
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| 基金项目： | 浙江省公益性技术应用研究计划项目（2012C32011）。 |
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| 摘 要： | WRKY转录因子以基因家族形式存在,在植物生长、发育和逆境反应中起着重要作用。二穗短柄草是大麦、小麦和禾本科牧草的模式植物,为了给基因表达和功能鉴定奠定基础,本研究利用生物信息学方法鉴定和分析其WRKY转录因子。结果表明,二穗短柄草有76个WRKY基因,它们具有0～6个内含子,编码区全长396～2 847 bp,基因分布在5条染色体上;进化分析结果表明,二穗短柄草WRKY在系统发生树上聚为3组,分属于I、II和III类转录因子;核心序列除WRKYGQK外,还有WKKYGQK、WRKYGKK、WRKY-GEK、WRKYGQT和WKKYGPK等多种变异类型;锌指模体也存在多种变异,它们是C-X4-C-X21-H-X1-H、C-X3-C-X22-H-X1-H、C-X7-C-X28-H-X1-C、C-X7-C-X24-H-X1-C、C-X7-C-X26-H-X1-C、C-X6-C-X24-H-X1-C、C-X7-C-X33-H-X1-C、C-X6-C-X32-H-X1-C和C-X7-C-X32-H-X1-C。
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| 关 键 词： | 二穗短柄草 WRKY 基因家族 鉴定 |
Genome-wide Identification and Analysis of WRKY Gene Family Members from Brachypodium distachyon |
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| JIANG Ming,YIN Long-fei,ZHANG Zhi-xian,YU Qin-xin,LUO Li-li. Genome-wide Identification and Analysis of WRKY Gene Family Members from Brachypodium distachyon[J]. Journal of Triticeae Crops, 2012, 32(6): 1013-1020 |
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| Authors: | JIANG Ming YIN Long-fei ZHANG Zhi-xian YU Qin-xin LUO Li-li |
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| Affiliation: | 1(1.College of Life Science,Taizhou University,Linhai,Zhejiang 317000,China; 2.Taizhou Academy of Agricultural Research,Linhai,Zhejiang 317000,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Brachypodium distachyon WRKY Gene family Identification |
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