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紫薇EST-SSR标记的开发与利用
引用本文:张恩亮,王鹏,李亚,王淑安,李林芳,杨如同. 紫薇EST-SSR标记的开发与利用[J]. 北方园艺, 2016, 0(22): 107-111. DOI: 10.11937/bfyy.201622027
作者姓名:张恩亮  王鹏  李亚  王淑安  李林芳  杨如同
作者单位:江苏省中国科学院植物研究所,江苏南京,210014;江苏省中国科学院植物研究所,江苏南京,210014;江苏省中国科学院植物研究所,江苏南京,210014;江苏省中国科学院植物研究所,江苏南京,210014;江苏省中国科学院植物研究所,江苏南京,210014;江苏省中国科学院植物研究所,江苏南京,210014
基金项目:科技部农业科技成果转化资金资助项目(2013GB2C100185),江苏省农业科技自主创新资金资助项目(CX(14)2032),江苏省林业三新工程资助项目(LYSX[2015]13).
摘    要:以紫薇为试材,利用MISA软件对转录组测序获得45 308条unigenes中的SSR特征进行分析。结果表明:9 074条unigenes存在10 905个SSR位点,1 486条unigenes含有2个以上的SSR位点,550个位点是复合重复位点;从7 620个SSRs位点中设计出4 501对SSR引物;随机选择68对SSR引物进行检测,其中61对引物可以成功的扩增出清晰可用的条带,28对引物有多态性。

关 键 词:紫薇  EST-SSR  转录组测序  分子标记

Development and Utility of EST-SSR Markers in Lagerstroemia indica
ZHANG Enliang,WANG Peng,LI Ya,WANG Shu'an,LI Linfang,YANG Rutong. Development and Utility of EST-SSR Markers in Lagerstroemia indica[J]. Northern Horticulture, 2016, 0(22): 107-111. DOI: 10.11937/bfyy.201622027
Authors:ZHANG Enliang  WANG Peng  LI Ya  WANG Shu'an  LI Linfang  YANG Rutong
Abstract:
Keywords:
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