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番茄超氧化物歧化酶的生物信息学分析
引用本文:郭笑,苑广信,王曼力,赵南晰,李洪宇,安丽萍. 番茄超氧化物歧化酶的生物信息学分析[J]. 北方园艺, 2016, 0(21): 97-101. DOI: 10.11937/bfyy.201621025
作者姓名:郭笑  苑广信  王曼力  赵南晰  李洪宇  安丽萍
作者单位:北华大学药学院,吉林吉林,132013;北华大学药学院,吉林吉林,132013;北华大学药学院,吉林吉林,132013;北华大学药学院,吉林吉林,132013;北华大学药学院,吉林吉林,132013;北华大学药学院,吉林吉林,132013
基金项目:长白山药用动植物活性多肽研究与开发国家地方联合工程实验室资助项目(发改高技[2010]2455号),吉林省教育厅资助项目(吉教科合[2016]第75号).
摘    要:超氧化物歧化酶(SOD)是生物体内重要的抗氧化酶。以在NCBI数据库中注册的7种番茄SOD蛋白质为分析对象,利用生物信息学方法,分析了SOD蛋白质的理化性质、信号肽、糖基化位点、磷酸化修饰、一级和二级结构以及系统进化特点。结果表明:7种蛋白质间的理化性质存在较大差异;氨基酸序列中不含信号肽,均不是分泌蛋白;不同类型的番茄SOD中所含糖基化以及潜在磷酸化位点数目不同;它们的氨基酸序列同源性较低,二级结构也存在较大差异;系统进化树可作为番茄SOD家族蛋白遗传分化研究的重要依据。该研究为深入开展SOD的酶学特征及植物抗氧化的分子机制研究提供重要的理论依据。

关 键 词:番茄  超氧化物歧化酶  生物信息学  抗氧化

Bioinformatics Analysis of Solanum lycopersicum Superoxide Dismutase
GUO Xiao,YUAN Guangxin,WANG Manli,ZHAO Nanxi,LI Hongyu,AN Liping. Bioinformatics Analysis of Solanum lycopersicum Superoxide Dismutase[J]. Northern Horticulture, 2016, 0(21): 97-101. DOI: 10.11937/bfyy.201621025
Authors:GUO Xiao  YUAN Guangxin  WANG Manli  ZHAO Nanxi  LI Hongyu  AN Liping
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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