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遗传距离与利用微卫星进行系统树构建初探
引用本文:毛永江,常洪,杨章平,张柳,许明,常国斌,孙伟,宋光明,HENNER Simianer.遗传距离与利用微卫星进行系统树构建初探[J].畜牧兽医学报,2008,39(2):129-135.
作者姓名:毛永江  常洪  杨章平  张柳  许明  常国斌  孙伟  宋光明  HENNER Simianer
作者单位:1. 扬州大学动物科学与技术学院,扬州,225009
2. Institute of Animal Breeding and Genetics,University of Goettingen,Goettingen,37075,Germany
基金项目:国家“863”计划(2002AA24211);国家自然科学基金(30571323);国家留学基金委资助项目
摘    要:以中国牛亚科家畜6个群体12对微卫星数据为基础,采用6种遗传距离(DA、DC、DS、DSW,(σμ)^2和DTL)和2种聚类方法(UPGMA和NJ法),探索它们对系统树构建准确性的影响。结果表明:微卫星位点平均杂合度水平显著影响系统树构建的准确性,用DA和DC遗传距离构建的系统树准确性相对较高,但很难确定NJ法和UPGMA法哪一种更适合于系统树的构建,而DTL遗传距离用于系统树构建有待进一步完善;最后,对微卫星用于家畜系统树构建的有效性和局限性进行了探讨。

关 键 词:系统树构建  微卫星  遗传距离
文章编号:0366-6964(2008)02-0129-07
收稿时间:2006-10-25
修稿时间:2006年10月25

The Relationship between Construction of Phylogenetic Trees and Genetic Distances from Microsatellite
MAO Yong-jiang,CHANG Hong,YANG Zhang-ping,ZHANG Liu,XU Ming,CHANG Guo-bin,SUN Wei,SONG Guang-ming,HENNER Simianer.The Relationship between Construction of Phylogenetic Trees and Genetic Distances from Microsatellite[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2008,39(2):129-135.
Authors:MAO Yong-jiang  CHANG Hong  YANG Zhang-ping  ZHANG Liu  XU Ming  CHANG Guo-bin  SUN Wei  SONG Guang-ming  HENNER Simianer
Abstract:
Keywords:reconstruction of phylogenetic tree  microsatellite  genetic distances
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