| 花椒窄吉丁气味结合蛋白AzanOBP3与其寄主挥发物的分子对接 |
| |
| 引用本文： | 郭莉,谢寿安,杨平,巩雪芳,陈迪,吕淑杰. 花椒窄吉丁气味结合蛋白AzanOBP3与其寄主挥发物的分子对接[J]. 植物保护学报, 2021, 48(2): 376-387 |
| |
| 作者姓名： | 郭莉 谢寿安 杨平 巩雪芳 陈迪 吕淑杰 |
| |
| 作者单位： | 西北农林科技大学林学院, 陕西 杨陵 712100;中国科学院成都生物研究所, 成都 610041 |
| |
| 基金项目： | 国家公益性行业（林业）科研专项（201504324），云南省林业科技推广示范项目（云[2019]TG01号），陕西省第二批特支计划领军人才项目（陕组通字2020-44号） |
| |
| 摘 要： | 为明确花椒窄吉丁Agrilus zanthoxylumi气味结合蛋白AzanOBP3与其寄主花椒Zanthoxylum bungeanum主要气味挥发物的结合模式及结合能力,利用Signal P 5.0和ProParam Tool-ExPASy软件对AzanOBP3的基本理化性质进行生物信息学分析,采用Swiss-Model对AzanOBP3序列进行同源建模,通过SAVES 5.0软件中Verify-3D、ERRAT以及ProCheck模块评价模型,应用AutoDock Tool 1.5.6软件对AzanOBP3模型和46种主要寄主挥发物进行分子对接分析。结果显示,花椒窄吉丁气味结合蛋白AzanOBP3同源建模所得模型质量较好,其Verify-3D、ERRAT以及ProCheck得分均符合同源建模要求。AzanOBP3与46种花椒气味挥发物主要以氢键、疏水作用和范德华力相结合,其中,13种链状配体与AzanOBP3的结合能力总体上弱于33种环状配体,链状配体中的芳樟醇和环状配体中的荜澄茄油烯与AzanOBP3表现出较好的结合能力,自由结合能分别为-5.2 kJ/mol和-6.6 kJ/...
|
| 关 键 词： | 花椒窄吉丁 气味结合蛋白 寄主挥发物 同源建模 分子对接 |
| 收稿时间： | 2020-07-29 |
Molecular docking of AzanOBP3 in jewel beetle Agrilus zanthoxylumi with its host volatiles |
| |
| Affiliation: | College of Forestry, Northwest A&F University, Yangling 712100, Shaanxi Province, China;Chengdu Institute of Biology, Chinese Academy of Sciences, Chengdu 610041, Sichuan Province, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Agrilus zanthoxylumi odorant binding protein host volatile homology modeling molecular docking |
|
| 点击此处可从《植物保护学报》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《植物保护学报》下载全文 |
|
