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青杄类伸展蛋白基因PwELP1的克隆及表达分析
引用本文:郜银涛,周燕妮,罗朝兵,等. 青杄类伸展蛋白基因PwELP1的克隆及表达分析[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2016, 44(10): 83-90,99
作者姓名:郜银涛  周燕妮  罗朝兵  
作者单位:西北农林科技大学 生命科学学院,北京林业大学 林学院,森林培育与保护教育部重点实验室,北京林业大学 林学院,森林培育与保护教育部重点实验室
基金项目:国家自然科学基金面上项目(31270663)
摘    要:【目的】克隆青杄类伸展蛋白(extensin-like proteins,ELPs)基因PwELP1并分析该基因的表达特性,为研究ELP基因家族的功能奠定基础。【方法】以青杄cDNA文库为模板,用RACE-PCR方法克隆青杄类伸展蛋白编码基因PwELP1的cDNA全长,利用DNAMAN确定PwELP1的编码框及蛋白氨基酸的翻译,运用clustalx软件与Espript工具进行多序列比对,利用MEGA 5软件的邻位相连法构建系统树,并对编码蛋白进行生物信息学分析;利用RT-qPCR检测PwELP1基因在青杄不同组织中表达的特异性、花粉和种子不同萌发时期及幼苗受到不同逆境处理时的表达差异,分析该基因的组织发育及逆境响应表达特点。【结果】PwELP1基因全长832bp,其编码一个由159个氨基酸组成的蛋白,该蛋白的N端与C端均有比较保守的结构域;此蛋白二级结构由1个α-螺旋、5个β-折叠与3个β-转角结构构成,对其三级结构的预测印证了这一结果,同时发现该蛋白中还存在部分无规则卷曲。其分子质量为17.03ku,理论等电点为5.81。PwELP1在青杄花粉中的表达量较高,且在花粉萌发后期(30~36h)以及种子萌发初期(第2天)表达量高;PwELP1的表达不同程度地受低温、高温、茉莉酸甲酯(MeJA)、H_2O_2、脱水以及脱落酸(ABA)等非生物逆境胁迫处理的诱导,尤其是H_2O_2、高温和ABA,处理初期表达量就显著升高。【结论】PwELP1在青杄花粉和种子萌发过程中可能发挥重要功能,并可参与青杄对非生物逆境胁迫的响应过程。

关 键 词:青杄;类伸展蛋白;组织表达;非生物胁迫
收稿时间:2015-03-10

Cloning and expression analysis of PwELP1 gene in Picea wilsonii
GAO Yintao,ZHOU Yanni and LUO Chaobing,et al. Cloning and expression analysis of PwELP1 gene in Picea wilsonii[J]. Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition), 2016, 44(10): 83-90,99
Authors:GAO Yintao  ZHOU Yanni  LUO Chaobing  et al
Abstract:
Keywords:Picea wilsonii  extension-like protein  tissue expression  abiotic stresses
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