绵羊组织特异性长链非编码RNA的鉴定与功能分析

本研究通过对绵羊不同组织的转录组分析，获得了肌肉、皮肤、脂肪组织的特异性长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)集合，预测了其上下游10 kb/100 kb区域内的蛋白编码基因，并基于皮尔森系数建立了lncRNA-mRNA调控网络，同时通过AnimalQTLdb数据库对可能具有重要经济性状的lncRNA进行筛选。结果表明，共预测出36340条lncRNA,基于τ指数对其进行组织特异性筛选，鉴定到213条肌肉特异性lncRNA,467条皮肤组织特异性lncRNA,295条脂肪特异性lncRNA。这三种组织特异性lncRNA的上下游基因可能分别参与调控肌肉生长、表皮发育、脂肪合成等生物学过程。通过构建的lncRNA-mRNA互作网络发现了2个重要表达模块，分别与角质化和脂肪合成相关。QTL分析表明，有14个lncRNA可能作为绵羊肌肉与脂肪相关性状的候选lncRNA。研究结果为lncRNA在绵羊育种工作中的应用提供借鉴和参考。