| 桐花树叶片的转录组分析 |
| |
| 引用本文： | 赵宇航,张守信,冉闽媛,郭昱昕,周勇芝,杨小波,龙文兴,周韬. 桐花树叶片的转录组分析[J]. 分子植物育种, 2019, 17(7): 2133-2143 |
| |
| 作者姓名： | 赵宇航 张守信 冉闽媛 郭昱昕 周勇芝 杨小波 龙文兴 周韬 |
| |
| 作者单位： | 海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228;海南大学热带农林学院,海口,570228 |
| |
| 基金项目： | 海南省自然科学基金项目;海南大学教育教学研究项目;海南大学大学生创新创业训练计划项目 |
| |
| 摘 要： | 为了进一步了解桐花树耐盐的分子机制,本研究采用Illumina HiSeq 2000高通量测序平台对桐花树叶片转录组进行测序,经de novo组装后获得73 721个Unigenes,进一步利用7个公共数据库(NR, NT,GO, COG, KEGG, SwissProt和InterPro)进行比对,注释了50 338个Unigenes。结果表明,有34 991个Unigenes参与到136条KEGG通路上,其中在花青素和类黄酮合成途径中的Unigenes分别有49个和176个,这些基因可能参与了桐花树应对逆境的调控过程;此外,从转录组序列中搜索到34 509个SSR位点,其中二碱基重复出现次数最多,出现频率为65.75%;从转录组的数据中预测到了2 255个转录因子,分属于58个家族。本研究结果为桐花树的基因功能分析、分子标记开发和遗传多样性研究提供一定的理论参考。
|
| 关 键 词： | 桐花树 高通量测序 转录组 |
Transcriptome Data Analysis of Aegiceras corniculatum Leaves |
| |
| Zhao Yuhang,Zhang Shouxin,Ran Minyuan,Guo Yuxin,Zhou Yongzhi,Yang Xiaobo,Long Wenxing,Zhou Tao. Transcriptome Data Analysis of Aegiceras corniculatum Leaves[J]. Molecular Plant Breeding, 2019, 17(7): 2133-2143 |
| |
| Authors: | Zhao Yuhang Zhang Shouxin Ran Minyuan Guo Yuxin Zhou Yongzhi Yang Xiaobo Long Wenxing Zhou Tao |
| |
| Affiliation: | (College of Tropical Agriculture and Forestry, Hainan University, Haikou, 570228) |
| |
| Abstract: | Zhao Yuhang;Zhang Shouxin;Ran Minyuan;Guo Yuxin;Zhou Yongzhi;Yang Xiaobo;Long Wenxing;Zhou Tao(College of Tropical Agriculture and Forestry, Hainan University, Haikou, 570228) |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录！ |
|
