| 亚洲棉、雷蒙德棉和陆地棉NRAMP基因家族的鉴定和进化分析 |
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| 引用本文： | 卢婷婷,王文佳,李存法,侯春彬. 亚洲棉、雷蒙德棉和陆地棉NRAMP基因家族的鉴定和进化分析[J]. 分子植物育种, 2019, 17(7): 2077-2085 |
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| 作者姓名： | 卢婷婷 王文佳 李存法 侯春彬 |
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| 作者单位： | 河南牧业经济学院,郑州,450046;河南大学生命科学学院,植物逆境国家重点实验室,棉花生物学国家重点实验室,开封,475004;河南牧业经济学院,郑州,450046 |
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| 基金项目： | 河南省科技厅科技攻关计划;河南牧业经济学院骨干教师项目 |
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| 摘 要： | 自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP)家族是跨膜转运蛋白家族,参与多种金属离子的转运过程。为了更好了解棉花NRAMP基因的成员和特征,二倍体和四倍体棉花之间的进化关系,本研究利用二倍体亚洲棉、雷蒙德棉和陆地棉基因组的氨基酸序列对三个棉种中的NRAMP家族成员进行鉴定,分析了NRAMP家族的种类、理化性质、进化关系、基因结构、蛋白基序、染色体定位、共线性关系和选择压力。结果显示,在二倍体亚洲棉基因组(A)中确定12个成员,在二倍体雷蒙德棉基因组(D)中确定15个成员,在四倍体陆地棉基因组(At, Dt)中确定23个成员。按照进化关系的远近将这50个成员分为3个亚类,进化关系较近的成员之间具有更为相似的理化性质、基因结构和蛋白质基序;通过和其他植物的进化关系分析发现,NRAMP基因在单子叶和双子叶植物分离前已经产生;染色体定位发现NRAMP在染色体上的分布并不规律;共线性分析和选择压力分析表明,片段复制在棉花NRAMP基因的遗传进化过程中发挥主导作用,同源基因对在进化过程中处于纯化选择。
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| 关 键 词： | 自然抗性相关巨噬细胞蛋白(NRAMP) 基因家族 鉴定 进化分析 棉花(Gossypium) |
Identification and Evolution Analysis of NRAMP Gene Family in Gossypium arboretum,Gossypium raimondii and Gossypium hirsutum |
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| Lu Tingting,Wang Wenjia,Li Cunfa,Hou Chunbin. Identification and Evolution Analysis of NRAMP Gene Family in Gossypium arboretum,Gossypium raimondii and Gossypium hirsutum[J]. Molecular Plant Breeding, 2019, 17(7): 2077-2085 |
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| Authors: | Lu Tingting Wang Wenjia Li Cunfa Hou Chunbin |
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| Affiliation: | (Henan University of Animal Husbandry and Economy, Zhengzhou, 450046;State Key Laboratory of Cotton Biology, Henan Key Laboratory ofPlant Stress Biology, College of Life Sciences, Henan University, Kaifeng, 475004) |
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| Abstract: | Lu Tingting;Wang Wenjia;Li Cunfa;Hou Chunbin(Henan University of Animal Husbandry and Economy, Zhengzhou, 450046;State Key Laboratory of Cotton Biology, Henan Key Laboratory ofPlant Stress Biology, College of Life Sciences, Henan University, Kaifeng, 475004) |
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| Keywords: | Natural resistance-associated macrophage protein (NRAMP) Gene family Identification Evolution analysis Cotton (Gossypium) |
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