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贵州省部分PEDV流行株ORF3基因克隆与遗传进化分析
引用本文:万 娟,梁海英,曾智勇,汤德元,王 彬,张婧旭,柳佳佳,边孟婷,黄 书,潘向英,田红利. 贵州省部分PEDV流行株ORF3基因克隆与遗传进化分析[J]. 中国动物检疫, 2023, 40(4): 19-24
作者姓名:万 娟  梁海英  曾智勇  汤德元  王 彬  张婧旭  柳佳佳  边孟婷  黄 书  潘向英  田红利
作者单位:贵州大学动物科学学院
基金项目:贵州省科技支撑计划项目(黔科合支撑〔2021〕一般162项目)
摘    要:为探究贵州省猪流行性腹泻病毒(PEDV)流行毒株的遗传进化情况,对2017—2022年贵州省不同地区13份PEDV阳性腹泻样本进行ORF3全基因扩增、克隆、测序,使用DNAstar、MEGA 7.0软件,对所得序列核苷酸和氨基酸同源性以及突变和遗传进化情况进行分析。结果显示:13份PEDV阳性样品的ORF3基因序列全长均为675 bp,编码224个氨基酸;13条克隆序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为95.1%~100%和96.4%~100%;13条克隆序列与经典毒株CV777株ORF3基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为95.9%~97.3%和94.7%~96.4%,同源性较低;与经典毒株CV777株相比,13条克隆序列在G160A、C243T、C274T、G301A、C450T、A497G存在相同的核苷酸突变,存在4个相同的氨基酸位点突变(V21A、V54I、A101T、N166S);13条克隆序列所在毒株在遗传进化上全部属于GⅡ型,其中GZ220514、GZ342、GZ224、GZ219、GZ423隶属于GⅡb亚型,GZ210112、GZ210129、GZ210220、GZ210714、...

关 键 词:猪流行性腹泻病毒  ORF3基因  遗传进化分析  克隆

Cloning and Genetic Evolution Analysis of ORF3 Genes of Some PEDV Strains in Guizhou Province
Wan Juan,Liang Haiying,Zeng Zhiyong,Tang Deyuan,Wang Bin,Zhang Jingxu,Liu Jiaji,Bian Mengting,Huang Shu,Pan Xiangying,Tian Hongli. Cloning and Genetic Evolution Analysis of ORF3 Genes of Some PEDV Strains in Guizhou Province[J]. China Animal Health Inspection, 2023, 40(4): 19-24
Authors:Wan Juan  Liang Haiying  Zeng Zhiyong  Tang Deyuan  Wang Bin  Zhang Jingxu  Liu Jiaji  Bian Mengting  Huang Shu  Pan Xiangying  Tian Hongli
Abstract:
Keywords:
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