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多倍体同源区段二代测序生物信息学分析关键参数优化
引用本文:武建楠,陈肯,王欢,庞铂实,周宇荀,肖君华,李凯.多倍体同源区段二代测序生物信息学分析关键参数优化[J].棉花学报,2021,33(6):504-512.
作者姓名:武建楠  陈肯  王欢  庞铂实  周宇荀  肖君华  李凯
作者单位:东华大学化学化工与生物工程学院,上海201620;上海农林职业技术学院,上海201699
摘    要:目的]多倍体植物同源区段单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)标记分型挑战颇大.本研究以四倍体陆地棉同源区段聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction,PCR)靶向扩增子数据集为例,观测同源区段的影响并优化生物信息学分析方案.方法]首先扩增并测...

关 键 词:棉花  同源区段  单核苷酸多态性  靶向二代测序  基因分型
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