禽脑脊髓炎病毒与其他小RNA病毒基因组序列比较分析

利用生物信息学方法对在基因文库中有完整注释信息的禽脑脊髓炎病毒(AEV)和其他小RNA病毒进行了基因组结构比较,发现小RNA病毒基因组结构的共性和个性;利用DNAMAN 5.0软件对小RNA病毒进行了基因组和蛋白多序列比对,并建立了蛋白质系统进化树。结果表明,AEV与甲肝病毒(HAV)的基因组结构最为相似;它们的基因组序列和蛋白序列的同源性最大,蛋白系统进化树的构建更进一步证明AEV与HAV的亲源关系最近;另外,经多序列比对发现猪肠道病毒A、鸭小RNA病毒TW90A型与猿猴小RNA病毒1型三者之间具有最大的序列同源性,并处于同一个进化树分枝,因此,建议将它们划分为一个新的小RNA病毒属,同时也为其他小RNA病毒科属种的划分提供了参考。