| 猪圆环病毒2型HB-MC1株全基因组序列测定与分析 |
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| 引用本文： | 左奕,袁万哲,孙继国.猪圆环病毒2型HB-MC1株全基因组序列测定与分析[J].河北农业大学学报,2015(1). |
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| 作者姓名： | 左奕 袁万哲 孙继国 |
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| 作者单位： | 河北农业大学动物医学院/河北省兽医生物技术工程技术研究中心,河北 保定,071001 |
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| 基金项目： | 河北省畜牧兽医局科技项目(2014303)． |
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| 摘 要： | 参照发表的猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV2)全基因组序列,设计合成了1对特异性引物,对2014年从河北省满城县某发病猪场分离到的1株PCV2(命名为HB-MC1)的全基因组进行了序列测定。应用DNAStar序列分析软件,对所测序列与GenBank中登录的PCV2序列进行同源性比较,结果显示,HBMC1株的基因组全长为1 767nt,其ORF1序列与GenBank登录的一些具有代表性的PCV2参考序列同源性高达97.2%~99.9%,其ORF2同源性在89.9%~99.6%之间。进化树分析结果显示,该毒株为PCV2d亚型,毒株部分核苷酸位点显示其属于强毒力毒株。研究结果揭示了HB-MC1株基因组特征与基因亚型,丰富了PCV2的基因组信息数据。
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| 关 键 词： | 猪圆环病毒2型 全基因组 序列测定 变异分析 |
Sequencing and analysis on complete genome of porcine circovirus type 2st rain HB-MC1 |
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| ZUO Yi,YUAN Wan-zhe,SUN Ji-guo.Sequencing and analysis on complete genome of porcine circovirus type 2st rain HB-MC1[J].Journal of Agricultural University of Hebei,2015(1). |
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| Authors: | ZUO Yi YUAN Wan-zhe SUN Ji-guo |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | porcine circovirus type 2 genotype sequence variation analysis |
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